番茄中与病害密切相关mirna的功能分析

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1、犬il嫂-大學DALIANUNIVERSITYOFTECHNOLOGY硕士字位记文MASTERALDISSERTATION番莉中与病害密切相关miRNA的功能分析I学科专业生物化工作者姓名孙广鑫指耳教IM栾雨时副教授2015年69日答辩日期月硕士学位论文番前中与病害密切相关miRNA的功能分析FunctionalanalysisofmiRNAscloselyassociatedwiththepathogenicityintomato作者姓名:孙广

2、鑫.学科、专业:生物化工学号:21218121指导教师:楽雨时副教授完成日期:2015年5月大違理工大摩DalianUniversityofTechnologyr大连理工大学学位论文独创性声明作者郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知,除文中已经注明引用内容和致谢的地方外,本论文不包含其他个人或集体已经发表的研究成果,也不包含其他已申请学位或其他用途使用过的成果一。与我同工作的同志对本研究所做的贡献均巳在论文中做了明确的说明并表示了

3、谢意。若有不实之处,本人愿意承担相关法律责任。学位论文题目:卷知?為爲彩切掘表吨作者签名:珠f条日期:读年6月/2^日?.大连理工大学硕士学位论文摘要一nMicroRNA(miRNA是类在生物体内普遍存在的长度约22t的内源性非编码小)分子RNA。近年的研究表明,miRNA在植物与病原物互作过程中起着重要的调节作用。。当病原物侵染番前时,常造成严重的病害,给番前的生产带来较大的经济损失虽然,目前关于番燕中与病害相关miRNA已有研究,但是,关于番燕中与病害密切相关miRNA。的研宄还不系统

4、基于上述状况,本研宄利用生物信息学方法,挖掘到番前中与病害密切相关的miRNA,并通过生物学实验方法探宄了关键miRNA的功能。首先,本研宄通过搜集文献和miRBase数据库,找到了番痴中34个miRNA的表达与病害相关,釆用生物信息学方法预测它们的範基因,利用Cytoscape软件构建miRNA间的调控网络,从中蹄选出13个与病害密切相关的miRNA。根据各miRNA之间关联一性的大小及其与病害相关IE基因的多少69、miR482、miR5300、,又进步选出miR1miR6024、miR6026和miR6027共6个关键

5、miRNA,并对其进行了IE基因功能分析、启动子分析及实时定量PCR验证。,为全面深入研宄miRNA的作用机制奠定了基础其次,挑出最为关键的miR482b和miR6024作为本文的重点研宄对象,釆用实时定量PCR技术分析了二者的组织特异性,以及在病原菌和SA胁迫下两个miRNA与其紀基因的表达模式。结果发现,且,两个miRNA在叶中的表达量均高于根和莲中的均能对上述胁迫做出响应,并与各自靴基因呈负相关。暗示这两个miRNA可能通过调控範基因的表达进而参与番煎对逆境的胁迫响应过程。一最后,为了进步探究miR482b和miR

6、6024的功能及作用机制,本文分别克隆了番郝中的MIR4S2b和MIR6024基因,成功构建了相应的过表达载体及瞬时转化体系,并获得了转基因番前植株。经检测发现,,转基因番前中miR482b的表达量上调其相应IE基因的表达量出现不同程度的下调,且提高了病原菌对番琉的致病能力。多项结果表明miR482b和miR6024可能在番煎响应逆境胁迫过程中均起着重要作用。、总之,挖掘及鉴定了番本研究通过生物信息学与生物学实验相结合的手段,预测痴中与病害密切相关的miRNA,并对其进行了相关功能分析。不仅可以加深人们对植。物与病原

7、物互作机制的了解,同时也可为番琉的抗病育种奠定基础关键词:miRNA基因病原物;乾;番庙;--I番煎中与病害密切相关miRNA的功能分析FunctionalanalsisofmiRNAscloselassociatedwiththeyyathoenicityintomatopgAbstractMicroRNAs(miRNAs)areaclassofendogenous,noncodingRNAsof22ntandwidelyexistinorganism.There

8、centstudieshaveshownthatmiRNAlaysanimortantrolein,

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