基于贝叶斯算法的中国西门塔尔牛胴体性状基因组选择的初步研究

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4、ｔｒａｉｔｓｙｇｇｅｎｏｍｉｃｓｅｌｅｃｔｉｏｎｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｙｓｔｕｄｙｉｎＣｈｉｎｅｓｅｓｉｍｍｅｎｔａｌｃａｔｔｌｅ研究生姓名董航言指导教师黄生强副教授合作指导教师李俊雅研究员学科专业动物遗传育种与繁殖研究方向分子数量遗传学论义答辩日期２０１５．５．２８答辩委贾会主席柳小春论文评阅人陈斌彭英林燕海峰二〇—五年六月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在指导老师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过

5、的研究成果，也不包含为获得湖南农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：时间：年月／曰（（关于论文使用授权的说明本人完全了解湖南农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留送交论文的复印件和电子稿，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等，允许论文被查阅和借阅复制手段保存、汇编学位论文。同意湖南农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容，并同意将由此产生的收益捐贈给学校教育基金会用于发展研究生教育。保密的学位论文在

6、解密后应巧守此协议（）研究生签名；时间；年月《日＾（暮（＾＾＾寺导师签名；斷今１片Ｂ笔《叫ｍ要摘要自２００１年Ｍｅｕｗｉｓｓｅｎ提出全基因组选择（Ｇｅｎｏｍｉｃｓｅｌｅｃｔｉｏｎ，ＧＳ）理论Ｗ来，动物育种技术从标记辅助选择（ｍａｒｋｅｒａｓｓｉｓｔａｎｔｓｅｌｅｃｔｉｏｎ，ＭＡＳ）的分子水平提高到了ＧＳ一的组学水平。，实现了动物育种技术的又次跨越随着生物芯片技术、高通量测序技术Ｗ及计算机技术的快速发展，在当下生命科学领域的大数据时代，使基因组选择技术在动物育种领域的应用成为可能。本研究利用８２１头中国西口塔尔牛资源群

7、体，用基于高密度基因分型芯片数据对其米龙、和尚头、黄瓜条、后膊子和臀肉共５个性状进行ＧＳ研究。首先，利用上述５个性状进行虽著环境效应的筛选研究，并构建环境效应方程。其次，对上述５个性状进行－Ａ－ＳＴＢ巧ｅｓ、ＳＴＢ巧ｅｓＢ和ＳＴ＊ｉｉｙｅｓＣＰ巨种算法的单性状（ｓｉｎｇｌｅ杠ａｉｔ，ＳＴ）基因组估计育种值（Ｇｅｎｏｍｉｃｅｓｔｉｍａｔｅｂｒｅｅｄｉｎｇｖａｌｕｅ，ＧＥＢＶ），构建Ｈ种Ｂａｅｓｉａｎ算法的全基ｙ因组效应值图谱－ＢａｅｓＢＶＳＴ－ＢａｅｓＡ。其中ＳＴｙ算法的ＧＥＢ估