基于双功能裂开型核酸适配体的肿瘤细胞检测研究

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1、学校代号10532学号S151100948分类号密级公开硕士学位论文基于双功能裂开型核酸适配体的肿瘤细胞检测研究学位申请人姓名：孙玉琼培养单位：化学化工学院导师姓名及职称：王柯敏教授羊小海教授学科专业：分析化学研究方向：纳米尺度及分子水平上的生化分析论文提交日期：2018年05月22日学校代号：10532学号：S151100948密级：公开湖南大学硕士学位论文基于双功能裂开型核酸适配体的肿瘤细胞检测研究学位申请人姓名：孙玉琼导师姓名及职称：王柯敏教授羊小海教授培养单位：化学化工学院专业名称：分析化学论文提交日期：2018年5月

2、22日论文答辩日期：2018年5月28日答辩委员会主席：吴海龙教授DetectionofTumorCellsBasedonBifunctionalSplitAptamersbySUNYuqiongB.S.(HunanAgriculturalUniversity)2015AthesissubmittedinpartialsatisfactionoftherequirementsforthedegreeofMasterofscienceinAnalyticalchemistryintheGraduateschoolofHunanU

3、niversitySupervisorsProfessorWangKeminProfessorYangXiaohaiMay,2018I硕士学位论文摘要核酸适配体作为新兴的识别分子，具有高亲和力、高特异性、易合成修饰、设计灵活等优点，已经被广泛地应用于肿瘤诊断和治疗等领域。然而，核酸适配体往往存在序列较长、构型设计复杂、标记成本较高等缺点，因此，对其进行序列改造是非常有必要的。其中，通过对核酸适配体进行裂分获得的裂开型核酸适配体，巧妙地弥补了以上的缺点。此外，基于核酸适配体的light-up荧光探针为发展高信背比、高特异性和免标

4、记的检测方法提供了新的契机。基于此，本论文以发展免标记、低成本和高灵敏的肿瘤细胞检测方法为目标，通过对核酸适配体序列进行裁剪、裂分和拼接，设计了一种双功能裂开型核酸适配体探针，以肿瘤细胞为研究对象，建立了两种检测方法。具体研究内容如下：一、双功能裂开型核酸适配体的构建及其肿瘤细胞免标记检测研究利用人肝癌细胞系SMMC-7721的特异性核酸适配体与激活硫黄素T（ThT）荧光的核酸适配体，通过裁剪、裂分和拼接等过程，设计了一种新的双功能裂开型核酸适配体探针（BFSA）。BFSA与ThT混合后形成BFSA/ThT复合探针，此时ThT

5、的荧光被激活。该复合探针能够特异性结合靶细胞，通过洗涤去除多余探针，即可实现肿瘤细胞SMMC-7721的免标记和低成本检测。该探针在100μL结合缓冲液中最低检测到了125个细胞，且实现了对20%人血清样品中靶细胞的定量检测，此方法为肿瘤和医学诊断研究提供了一种新的思路。二、靶标介导组装的light-up荧光探针用于肿瘤细胞的一步式检测研究在上一个研究工作中，我们设计的BFSA虽然能够实现肿瘤细胞的免标记检测，但需要洗去未结合的探针来降低背景信号，使得操作较为复杂。如果将BFSA的一个片段与一条互补序列杂交，先封闭荧光染料的激

6、活区域，设计成一种激活式的荧光探针，有望解决以上问题。鉴于此，我们建立了一种靶标介导组装的light-up荧光探针：在无靶标时，BFSA的两个片段相互独立，并且其与ThT结合的区域被封闭，因此荧光信号微弱；而当靶标存在时，则会诱导各片段的组装，BFSA激活ThT荧光的功能恢复，从而产生强烈的荧光信号，实现肿瘤细胞SMMC-7721的免洗的一步式检测。该探针在100μL结合缓冲液中可检测到125个细胞，且在20%人血清样品中具有良好的稳定性。此外，该探针具有良好的选择性，可明显区分靶细胞与对照细胞。本方法只需将核酸适配体、荧光报

7、告分子与靶标混合便能产生可检测的荧光信号，实现了肿瘤细胞的免洗、免标记、低成本的一步式检测。三、自动化工作站辅助的人血管生长素核酸适配体的筛选研究在以上研究工作中，我们发现并非所有的核酸适配体都适合设计成裂开型探III基于双功能裂开型核酸适配体的肿瘤细胞检测研究针，因此，筛选更多的核酸适配体对解决这一问题显然是有帮助的。然而，经典的筛选方法过程繁琐、费时费力，非常有必要利用仪器设备来提高操作的自动化程度。有鉴于此，我们将自动化工作站引入到SELEX技术的操作流程中，以血管生长素（ANG）为靶标进行核酸适配体的筛选。目前已将恒温

8、孵育、磁分离、单链制备与纯化等操作集成在自动化工作站上完成。经过了12轮的筛选工作，一共选择了16条序列做进一步的表征。结果表明，Y8和Y18能够特异性结合ANG，解离常数分别为108.4nM和177.1nM。随后又对Y8和Y18进行了序列优化，发现将前后引物去掉后的Y8-1