结直肠癌中差异表达mirna的筛选与功能研究

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1、上海交通大学博士学位论文论文题目：结直肠癌中差异表达miRNA的筛选与功能研究姓名：傅佶泓指导教师：崔龙教授学科专业：外科学申请学位：博士学号：0500006答辩日期：2013年4月26日川Ⅷ舢洲Ⅷ删Ⅲ删川ⅢY2351454论文题目：结直肠癌中差异表达miRNA的筛选与功能研究作者姓名：傅佶泓学号：0500006指导教师：崔龙教授学科专业：外科学研究方向：大肠癌的表观遗传学申请学位：博士导师小组：陈卫副主任医师杜鹏主治医师关键词：结直肠癌；miRNA；生物芯片；培养单位：上海交通大学医学院附属新华医院资助基金项目：E海1砰}委麴酾院猷项目(10DJl400504)E海交通

2、大学医学院科技基金项目(1lQYJ003)匕海市自然基金(11ZRl424200)匕海市卫生局科研基金(20114221)IdentificationofDeregulatedmiRNAsinColorectalCancerandFunctionAnalysisAuthor’sName：FuJihongTutortsName：CuiLongMD，PhDSpecialty：Major：SurgeryEpigeneticofcolorectalcancerApplyforDegree：DoctordegreeTutorGroup：ChenWeiDnPengKeyWords：c

3、olorectalcancer；,miRNA；micro-arrayTrainingunit：XinhuaHospitalAffdiatedtoShanghaiJiaotongUniversitySchoolofMedicine研究生姓名傅佶泓学号osoo醇≈毫．嘎?导师姓名≯崔龙一一j‘、、，‘f．。』f’l／，论文题目结直肠癌中差异表达miRNA的筛逸蜘釜酾脘答辩日期学科(专业)外科学2013．4．26新华医院答辩地点答辩委员会成员姓名工作单位职称签名全志伟新华医院主任医师，教授刎钦胡志前长征医院主任医师，教授微康九红同济大学教授勉笼锄王立峰新华医院主任医师，教授礁岑

4、刘永忠上海肿瘤研究所教授．．韧。俐≯，表决结栗：一7一⋯～一，／一一．。一一崩缸一．傅龟觥主磊乡。㈣一，，’厅年rc月一／日学位论文原创性声明上海交通大学本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其它个人或集体己经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：彳耘日期：力3年9月版权使用授权书上海交通大学学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学

5、校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权上海交通大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密口，在年解密后适用本授权书。本学位论文属于／不保窀形(请在以上方框内打“4”)学位论文作者签名彳细日强：≯哆年5其I了Et⋯燧轹≯日期：刀j年，影日摘要结直肠癌中差异表达miRNA的筛选与功能研究中文摘要第—部分结直肠癌组织中差异表达miRNA的筛选及其调控靶基因的确定目的：研究结直肠癌中全基因组水平上miRNA．mlⅢA相互调控关系，明确结直肠癌中差异表达的mi

6、RNA下游的靶基因及其调控的信号通路。方法：利用miRNA芯片及mRNA芯片确认结直肠癌组织中miRNA及mRNA表达谱；应用Pearson相关性分析，选取表达水平呈明显负相关的miRNA-mRNA对，通过生物信息学筛选具有直接调控关系的miRNA-mRNA对，分析其参与的信号通路。应用realtimePCR及细胞实验验证预测结果。结论：通过芯片分析，共筛选出32个差异表达的miRNA及2916个差异表达的mRNA，应用芯片表达水平相关性分析及靶点预测软件共筛选出72对表达水平呈明显负相关的miRNA．mRNA对。其中包括22个差异表达的miRNA及58个差异表达mRNA

7、，通过信号通路分析表明wnt通路可能受这些差异表达的miRNA调控。realtimePCR在40例样本中对miRNA及mRNA表达水平进行验证，结果与：卷片结果一致。细胞实验发现KLF4可能是mir-29a的靶基因。结论：本研究共预测了在结直肠癌中miRNA-mRNA调控网络，确认了结直肠癌中差异表达的miRNA的靶基因，为进一步机制研究提供线索。关键词：结直肠癌；miRNA；靶基因；生物芯片第二部分：Mir-29a通过调控KLF4参与结直肠癌肝转移的研究目的：研究mir-29a在伴有肝转移的结直肠癌组织中表达水平，探讨其与临