新腹足目贝类dna条形码系统构建及系统发育研究

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1、谨以此文献给我的导师、我的亲人及所有热爱海洋生物分类与进化学的工作者-----------邹山梅新腹足目贝类DNA条形码系统构建及系统发育研究学位论文答辩日期：指导教师签字：答辩委员会成员签字：独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含未获得（注：如没有其他需要特别声明的，本栏可空）或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学

2、位论文作者签名：签字日期：年月日--------------------------------------------------------------------------学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》，并通过网络向社

3、会公众提供信息服务。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签字：签字日期：年月日签字日期：年月日新腹足目贝类DNA条形码系统构建及系统发育研究新腹足目贝类DNA条形码系统构建及系统发育研究摘要新腹足目隶属于腹足纲，种类繁多，其中包含约16000种海洋肉食性种类，为深海环境中一群主导性无脊椎动物类群，对海洋生态环境起着重要的调节作用。经过长期的形态演变之后，捕食行为成为新腹足目最显著的生物特征。新腹足目贝类包含大量重要的经济种类，如骨螺科、织纹螺科、塔螺科和滨螺科等经济贝类。这些经济种类都具有极其丰富的生物多样性。贝壳

4、外部特征和消化系统解剖结构为新腹足目贝类重要的分类特征。然而，由于外部环境的影响，这些分类特征具有极大的形态可塑性，且某些群体种内差异性较大而种间差异性较小。这都使得利用传统形态特征对新腹足目贝类进行物种鉴定和系统发育分析变得极其困难，从而导致新腹足目贝类的分类处于混乱状态。利用DNA序列进行物种多样性分析成为一种有效的研究途径。最新提出的DNA条形码（DNAbarcoding）技术，即利用一段短的DNA序列作为物种快速鉴定的标记，并希望以此建立DNA序列和生物物种之间一一对应的关系，已成功应用于动物、植物及微生物界。DNA条形码作为对地

5、球上现有物种进行识别和鉴定的一项新技术，受到国内外广泛关注。本研究利用DNA条形码技术和相关分子标记对新腹足目贝类，特别是一些经济种类，如骨螺科和织纹螺科贝类，进行了全面的物种鉴定和系统发育研究，并验证了DNA条形码及其分析方法的有效性。研究结果如下：1.骨螺科DNA条形码与系统发育研究本研究中，我们运用DNA条形码技术对中国沿海17个分类比较混乱的骨螺科种类进行了物种鉴定分析。COI、16SrDNA、ITS-1和28SrRNA四个基因位点被应用于120个个体的条形码和系统发育分析。首先，由于部分骨螺个体不能用COI和16SrDNA通用引

6、物成功扩增，我们设计出骨螺科COI和16SrDNA特异性扩增引物。研究结果显示COI基因能够成功区分所有研究种类，可以作为骨螺科理想的条形码标记基因。16SrDNA、ITS-1和28SrRNA也能够成功区分大部分研究种类，但是不能清楚鉴定一些近缘物种。另外，基于单基因数据I新腹足目贝类DNA条形码系统构建及系统发育研究集和整合数据集的分析结果显示爱尔螺亚科、红螺亚科、刍秣螺亚科和骨螺亚科均形成单系群，尤其是红螺亚科独自形成一单系群。本研究利用多基因位点并结合形态学特征对骨螺科种类，特别是一些经济种类，进行了有效的物种鉴定，对骨螺科种类的生

7、态学、群体学、养殖学等研究提供了有力的分类依据。2.织纹螺属（Nassarius）贝类隐存多样性研究本研究对中国沿海22个织纹螺属种类的220个个体进行了全面的DNA条形码分析。其中，我们从中国沿海采集到208个织纹螺个体，并对其进行COI和16SrDNA序列的扩增与测序，其他个体序列从Genbank下载获得。距离法、单系法和特征法条形码分析方法在本研究中得到成功的应用。但是相比距离法和单系法，特征法更具优越性。研究结果表明COI和16SrDNA邻接树及贝叶斯树都显示织纹螺属为单系群体。结合线粒体序列、核基因序列及形态特征，我们成功鉴定出

8、13个织纹螺种类，并揭示出4个隐存种和一对同物异名种类。如此成功的物种鉴定及隐存种发现对于织纹螺属的食品安全问题和多样性保护具有重大的意义，并提醒我们要更加关注被忽略的海洋隐存多样性现象。3.