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时间:2019-03-03
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1、中国蚁属16种蚂蚁系统发育及DNA条形码研究ResearchonPhylogeneticRelationshipandDNABarcodingamongSixteenSpeciesoftheGenusFormica(Hymenoptera:Formicidae)FromChina专业名称:动物学申请人:陈媛指导教师:周善义教授论文答辩委员会主席:委员中国蚁属16种研究生:陈嫒学科专业:动物学摘要本文对采自中国不同地区的蚁属Formica16种蚂蚁进行了分子DNA条形码研究,探讨条形码在物种鉴定上的可行性。以COl、ITSl
2、、ITS2为基础以及联合数据集COI+ITSl、COI+ITS2、COl+ITSI+ITS2,对所得150个样品的碱基序列进行了碱基成分、种间遗传距离、系统发育检验等分析,运用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、贝叶斯法(BI)等方法对数据集进行了系统发育分析,得到以下结论:(1)编码基因COI比非编码的内转录间隔区ITSl/ITS2更容易得到序列。成功得到COl序列的样品数为149个,成功率达到99.33%;而ITSl、ITS2的成功率分别为93.33%、91.33%。COl序列具A+T偏向性,而ITS区序列碱基偏向性则
3、偏向G+C。在碱基变异频率分析中,3个基因片段均有高的保守性,相比之下COI片段具有较多的变异位点,对近缘种类间区分具有明显的优势。.(2)种间遗传距离分析中,单个片段的ITSl、ITS2基因分析表明,蚁属种间遗传距离的差异较小,种间的同源性较高。而单个COI基因与其他3种联合数据集,结果基本一致:未知种Formciasp.与其他15种的亲缘关系最远;而种间关系较为密切的有北方蚁Faquilonia与多栉蚁Fpolyctena、亮腹黑褐蚁Fgagatoides与日本黑褐蚁F.japonica。(3)饱和性分析得到单个COl
4、基因片段以及COI+ITSl,COI+ITS2,COI+ITSI+ITS2数据集的碱基的转换和颠换均未达到饱和,可以用于系统发育分析;而在树长分布偏斜性分析中,这4类分子数据集的系统发育信号对最优树有较高支持率。因此,确定了用以下4个分子数据进行系统发育分析:COI,COI+ITSl,COI+ITS2,COI+ITSl+ITS2。(4)基于3种方法构建的系统发育树,除了贝叶斯方法构建的系统发育树对于联合数据集COI+ITS2及COl+ITSI+ITS2的实验结果没有得到理想的结果,其他2种方法构建的系统发育树基本一致,共有
5、9个物种能够单独聚成一支,分子数据与形态学分类高度吻合,这9个种分别为:中华红林蚁Fsinensis、满洲凹头蚁Fmanchu、乌拉尔蚁Furalensis、凹唇蚁Fsanguinea、亮腹黑褐蚁Fgagatoides、光亮黑蚁Fcandida、丝光蚁Ffusca、格劳卡蚁Fglauca、未知种Formciasp.。(5)DNA条形码能够作为蚁属物种识别的辅助工具。经过DNA条形码构建的系统发育树与传统形态学差异分析表明,北方蚁FaquiloniaYarrow,1955为多栉蚁FpolyctenaFoerste,l850的
6、同物异名。对满洲蚁Formicamanchu中同巢中立毛生长情况不一致的样品,DNA条形码技术能起到校正的作用。通过系统发育树的分析,本文猜测,在红林蚁群Fsinae中存在隐存种,这需要其他工作进行证实。(6)由于种内与种间的基因差异存在着广泛的重叠区,无明显的种间阈值存在,表明单依靠DNA条形码鉴定物种结果并不准确。因此应该多种方法的综合分类以达到准确鉴定物种的目的。关键词:蚁属,DNA条形码,系统发育,COl,ITSl,ITS2IIResearchonPhylogeneticRelationshipandDNABarc
7、odingamongSixteenSpeciesoftheGenusFormica(Hymenoptera:Formicidae)FromChinaMasterCandidate:YuanChenGrade:201Supervisor:Prof.ShanyiZhouMajor:Zoologydirection:ZootaxyandzoogeographyAbstractInthispaper,theDNAbrcodingof16speciesofthegenusFormicafromdifferentregionsofCh
8、inawerestudy,todiscussthefeasibilityontheirclassificationanddetermination.Forthe150specimens,weemployedCOl,ITS1,ITS2genesequencesandtheircomineddatasets
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