人类新基因识别和蛋白质结构域鉴定

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1、复旦大学博士学位论文人类新基圈识别与蛋白质结构域鉴定中文摘要本论文分为三部分，第一部分是1．54个人类新基因的识别及初步的实验分析；第二部分是关于人17种组织基因表达谱分析的相关生物信息学研究；第三部分为新的蛋白质结构域的鉴定与功能分析。在第一部分工作中，作者采用ESTs策略，通过多种方法，包括作者自己提出的一些新方法预测了154个人类新基因，并有约1／3已通过在多种组织的eDNA文库里进行PCR扩增和测序得到证实，其余基因的实验验证还在进行之中。这些基因包含了许多种类，本文按照GO分类法和Panther分类法对其进行了归类。这些

2、基因可作为进一步研究和开发的重要资源。作者以其中的RAB4l、ASB一17、LPAA-f及甘油酸激酶GLYTK·』和GLYCTK2等基因为例探讨了几种克隆基因的方法，并对这些基因功能进行了初步的探讨。第二部分采用数字差异显示的方法对760个Unigene在人类17种组织中的表达数据进行分析，结果显示人的大脑和睾丸的基因表达谱最为相似。这一结果可能提示了睾丸与大脑在人的物种形成和进化过程中都起着重要作用。第三部分介绍了两个新的蛋白质结构域(MANSC和MPPN)的鉴定工作。MANSC是一个出现于多细胞动物膜蛋白或细胞外蛋白中的dom

3、ain，包括低密度脂蛋白一11(LRP一11)、肝细生长因子激活物抑制蛋白抑制因子HAI一1(Hepatocytegrowthfactoractivatorinhibitor1)及许多未知的膜蛋白或细胞外蛋白。推测在HAI．1中，MANSC的功能可能是通过与肝细胞生长因子激活物(HGFA)g戈其类似物matHptase的结合而发挥功能。MPPN结构域与已知的RNA识别和结合结构域rrm具有密切关联，可能也起着RNA结合的作用，在细胞周期中可能发挥重要作用。关键词：基因克隆．ESTs策略，RAB41，LPAAT-‘，ASB一17，睾

4、丸，脑，基因表达，蛋白序列基序，甘油酸激酶，MANSC，MPPN墨呈查兰竖主兰垡笙壅△耋堑茎里里型兰兰鱼垦笪塑茎鳖塞ABSTRACTPresentdissertationconsistsofthreeparts：thefirstpartdescribesthesiliconcloningandsubsequentexperimentalpilotfunctionalanalysisof154humannovelgenes；thesecondpartdescribestheinsilicoanalysisofgeneexpressi

5、ondataof17humantissues，aswellasthethirdpartdescribestheidentificationoftwonovelproteinsequencemotifs．Intheworkdescribedinthefirstpart，mainlyviaESTsstrategy，combinedwithsomeothermethodsproposedbyauthor，theauthorpredictedandisolated154noveIhumancDNAgenes．about1／3ofwhich

6、havebeenverifiedbysubsequentPCRamplificationinvarioushumantissues．Experimentalverificationofothergenesisgoingon．Thesegenescoverawiderangeoftypesaccordingtotheirdifferentfunctions．whicharepostulatedtobeinvolvediadiverselifeprocessions，Theputativeproteinsofthesegeneswer

7、eclassifiedaccordingtobothG0andPanthermethods．Thesegenesareavaluablereservoirforfurtherinvestigationandpotentialforrelatedapplication．TheidentificationandpilotfunctionalanalysisofhumanRAB41andsomeothergenese．g．，冗AB4J、A5日．J7、LjMArfaswellasGLYTK．1andGLYCTK2wereintroduce

8、dasexamples，toelucidatevariousrecruitedcloningmethods．Inthesecondpart，theauthoranalyzedthegeneexpressiondataof760Unigenesamo