基于ssr标记的福建省若干水稻品种dna指纹图谱构建及遗传多样性分析

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1、福建农业学报25(1):33~_38,2010FujianJournalofAgriculturalSciences文章编号:1008—0384(2010)O1—033—06基于SSR标记的福建省若干水稻品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析马红勃,许旭明,韦新宇,杨旺兴,邹文广(福建省三明市农业科学研究所,福建沙县365509)摘要:以24份杂交稻品种和18份杂交稻亲本为材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。24对引物在研究材料中共检测到74个多态性片段,平均每对引物的多态性片段为3.1

2、个。基于24个SSR标记的扩增结果,利用NTSYS2.10e软件计算Dice遗传相似系数,并建立UPGMA聚类图,结果表明:42份材料之间的相似系数变化范围为0.6O~1.00,在遗传相似系数0.68处可以将42份材料分为6个类群,较好地反映了供试材料的亲缘关系,可为水稻育种中亲本选择提供参考。同时建立了42份材料×12个SSR标记的指纹图谱,为杂交水稻品种纯度和真伪鉴定提供科学数据。关键词:水稻;SSR;指纹图谱;遗传多样性中图分类号:S511;S326文献标识码:ADNAfingerprintsandgenet

3、icdiversityanalysisbasedonSSRmarkersforricecultivarsinFujianMAHong—bo,XUXu—ming,WEIXinyu,YANGWang-xing。ZOUWen-guang(SanmingInstituteofAgriculturalScience,Shaxian,FuJian365509,China)Abstract:SSRwasusedtOconstructtheDNAfingerprintsandanalyzethegeneticdiversityof

4、24hybridriceculti—varsand18parentalcuhivars.TwentyfourSSRprimersamplifiedatotalof74polymorphicDNAbands,averaging3.1bandsperprimer.Basedontheamplificationof24markers,geneticsimilaritycoefficientofdicewascalculatedusingthesoftware,NTSYS2.10e,andadendrogramofgene

5、ticrelationshipwasconstructedusingUPGMAmeth—od.Theresultsshowedthatthegeneticsimilarityamong42cuhivarsrangedfrom0.60—1.00,that42cultivarswereclassifiedintosixclustergroupswiththesimilaritycoefficientof0.68,andthatthegeneticrelativesamongcultivarswaswellreveale

6、d.Itwouldprovideascientificbasisforselectionofparentsforcrossbreedingrice.Afin—gerprintofSSRfor42cuhivarsatthe12primerlociwasobtained,whichwouldprovidescientificdataforidentifiea—tionaswellasdeterminationofpurityofthehybridrice.Keywords:Rice;SSR;fingerprintmap

7、;geneticdiversity近年来,DNA指纹鉴定技术飞速发展,无论方面应用最多的标记l1。本研究以24份杂交稻品是理论还是技术方面都取得了长足的进步。利用种和18份杂交稻亲本为材料,采用中国水稻研究DNA指纹技术构建作物品种的DNA指纹库,可所推荐的24个SSR标记¨g],对其遗传多样性进行以有效地进行品种纯度和真伪鉴定、新品种DUS分析,并建立了42份材料×12个SSR标记的测试、区试品种监控、侵权案司法鉴定、种质资源DNA指纹图谱,旨在为杂交水稻品种纯度和真伪遗传多样性分析等相关工作口]。SSR为共显性

8、标鉴定提供依据。记,与其他标记鉴定(如SRAPl8)相比较,SSR1材料与方法具有稳定性高、专一性强、带型简单、可靠性较高等优点,在水稻主栽品种SSR数据库构建、技术1.1试验材料体系优化、判别标准探讨等_2驯方面开展应用,具试验材料由福建省三明市农业科学研究所和福有广阔的前景。建省六三种业有限责任公司提供,品种名称及编号SSR标记是目前在水稻品种纯度和真伪

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