稻米胶稠度基因位点的标记和分析

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1、中国农业科学usssovvkyl}t∗x≥¦¬¨±·¬¤ªµ¬¦∏¯·∏µ¤≥¬±¬¦¤稻米胶稠度基因位点的标记和分析黄祖六tutvo谭学林o徐辰武o∂¤±¤√¬¦«¬·qkt扬州大学农学院数量遗传研究室o江苏扬州uuxss

2、~u云南农业大学水稻研究所~vªµ¬¦∏¯·∏µ¤¯¨±ª¬±¨¨µ¬±ª¦¨±·¨µo¤¶¨·¶¤µ·±¬√¨µ¶¬·¼o¤°³«¤±ª¶¤¨±o¤®²µ±°¤·«²°zvtwso׫¤¬¯¤±§l摘要}以硬胶稠度k≤l的≤×

3、

4、

5、v和中等胶稠度的tsx水稻品系杂交产生的txu个重组近交系kl为

6、材料o用ƒ°!ƒ°和微卫星k≥≥°l标记构建了v张分子标记连锁图o以此对控制稻米≤的数量性状位点k±×l进行了分析∀结果表明o稻米≤主要受位于第v染色体的两个连锁位点控制o它们分别位于utzs左!右两侧{q{¦和tz¦处∀上述两个位点都以大于tyqs的值检测到∀控制≤的微效±×的数目则因连锁图的不同而异o约为w∗

7、个∀关键词}稻米品质~胶稠度~数量性状位点~分子标记连锁图中图分类号}≥xttqsvu文献标识码}文章编号}sxz{2tzxukussslsy2ssst2sx柔软!有光泽的米饭是重要的品质育种目标∀胶稠度kª

8、¨¯¦²±¶¬¶·¨±¦¼o≤l遗传及其在育种上的应用已引起了人们广泛的注意1v2∀≤«¤±ª等用tss°ª的混合米粉测试o认为≤受1w2等认为1t2显性单基因控制o而¤°¤±≤受多个微效基因控制∀汤圣祥等采用y≅y完全双列杂交和改良单籽粒分析方法进行研究o认为≤受到一对主效基因和若干微效基因控制∀对≤的基因位点进行标记定位的报道很少∀为了对≤的遗传特性有更清楚的认识o本研究以粳稻≤×

9、

10、

11、v和泰国王牌香软米tsx杂交产生的重组近交系kl为材料o用分子标记技术构建水稻≤的±×图谱o对控制水稻≤的基因进行定位和效应分析∀

12、t材料与方法tqt植物材料选用遗传差异大的u个亲本≤×

13、

14、

15、v和tsxo前者是国际热带农业中心选育的陆粳稻品种o具有硬≤kvxqw°°lo后者是泰国具有最优蒸煮品质的籼稻品种o≤中等kxy1x°°lo配制杂种ƒt再经过{代连续自交获得ot

16、

17、y年将亲本及其栽种于泰国南卡巴通的¤¶¨·¶¤µ·大学温室o同年收获o每系混收xs株种子o晒干后立即测定∀tqu籽粒ΓΧ的测定参考1x2∏¯¬¤±²方法∀tqv分子标记ΡΦΛΠ!ΑΦΛΠ和ΣΣΛΠ分析本研究所用的分子标记有ƒ°!ƒ°和≥≥°等v种∀提取和≥²∏·«¨µ±吸印过程参考

18、1y2¦≤²∏¦«等方法o的限制酶消化参照生产商的方法∀ƒ°的探针一部分来自康乃尔大学o一部分来自日本水稻基因组计划k°l∀其中是美国的水稻基因组随收稿日期}t

19、

20、

21、2s

22、2st基金项目}洛克菲勒基金项目和国家自然科学基金资助项目kv

23、

24、sss{sl作者简介}黄祖六kt

25、w{2lo男o江苏宜兴人o副教授o农学硕士o主要从事作物数量遗传与生物统计研究∀u中国农业科学vv卷机克隆!为¦克隆!≤为燕麦的¦基因组克隆o!!≤!×!!为日本水稻基因组随机克隆o这些探针与z种限制性内切酶kΔρα!Ξβα!ΕχοΡ!ΕχοΡ∂!Ηι

26、νδ!Βγλ和ΒαμΗl探针组合o产生多态性分子标记∀根据日本水稻基因组计划和康乃尔大学的ƒ°连锁图确定ƒ°标记连锁群及其对应的染色体o采用°∞Ù∞÷°vqs软1z2确定分子标记的顺序件o构建ƒ°分子标记的连锁图框架∀ƒ°分子标记参照1{2的方法进行¤¦®¬¯¯等o以t2¬!×tt2¬!≤ty2¬!×tt2¬!utz2¬k¬t!u!,l表示∀1

27、2的方法≥≥°标记参照°¤±¤∏§等o以表示∀然后根据值将ƒ°和≥≥°标记加到ƒ°连锁图上o以增大饱和度o构建ƒ°2ƒ°2≥≥°连锁图∀以此为基础进行1ts2计算±×分析∀图距

28、采用¤¯§¤±¨函数∀tqwΘΤΛ的定位和效应分析1tt2≤的±×用°∞Ù±×tqt检测o±×的阈值定为uqs∀在ƒ°!ƒ°2ƒ°和ƒ°2ƒ°2≥≥°连锁图上分别用峰来定位∀因借用该软件的1u2≤模型计算o其加性效应和遗传方差分别扩大u倍和w倍o所以必须将按≤计算的加性效应值除以uo而遗传方差则应除以wo从而得到相应的遗传参数∀u结果与分析uqt性状表现参试母本≤×

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30、

31、v的≤为vxqwu?sqywxx°°o父本tsx为xyqx?sqzxyv°°o双亲间差异达到极显著水平∀的极差为us∗{s°°o方差为tywqxyo表

32、明后裔的分离是非常大的∀uqu连锁图的基本情况ƒ°!ƒ°和≥≥°标记数分别为{v!y

33、和txov张连锁图的基本情况见表t∀表tv张图谱标记间距的平均数和均方פ¥¯¨t√¨µ¤ª¨ª¨±¨·¬¦§¬¶·¤±¦¨k¦l¥¨·º¨¨±°¤µ®¨µ¶¤±§¬·¶°¨¤±¶´∏¤µ¨¶¬±·«µ¨¨¯¬±®¤ª¨°¤³¶图谱类型数量平均数