ssr标记技术在植物遗传多样性研究上的应用

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1、ChineseAgriculturalScienceBulletinVol.22No.72006July·90·http://www.casb.org.cn农业生物技术科学SSR标记技术在植物遗传多样性研究上的应用杨进(荆门职业技术学院生物工程系,湖北荆门448000)摘要:微卫星(microsatellites)或简单序列重复(simplesequencerepeats,SSRs)是以1~6个碱基为基本单元的串联重复序列,具有含量丰富、多态性高、共显性和检测方法简单等优点,是研究植物遗传多样性的优异的分子标记之一,已被用于多种植物的遗传多样性研究。概述

2、了微卫星DNA标记的原理及特点,介绍了其实验技术方法及发展,探讨了其在植物遗传多样性中的应用和发展前景。关键词:微卫星DNA标记;遗传多样性;植物中图分类号:Q75文献标识码:ATheApplicationofMicrosatelliteDNAMarkerinPlantGeneticDiversityResearchYangJin(DepartmentofBiologicalEngineering,JingmenTechnicalCollege,JingmenHubei448000)Abstract:Microsatellite,alsoknownass

3、implesequencerepeats,wasrandomrepetitivesequencescom-posedofmotifof1~6bp.Asithadmanyadvantages,suchasabundance,highpolymorphism,codomi-nance,simpleprocess,microsatelliteDNAmarkerwasoneoftheexcellentmolecularmarkerinplantge-neticdiversityresearch.Ithadbeenappliedtogeneticdiversity

4、researchinmanyplants.Thetheoryandcharacteristicswasbrieflysummarized.Itsexperimentationmethodsanddevelopmentwaspresented.Theapplicationandfutureinplantgeneticdiversityresearchwasdiscussed.Keywords:MicrosatelliteDNAmarker,Geneticdiversity,Plant微卫星(microsatellites)或简单序列重复(simple要丰富

5、得多[4~7]。拟南芥、大豆、玉米、大麦、水稻、西红sequencerepeats,SSRs)是以1~6个碱基为基本单元的柿等重要植物的SSR位点已被整合到遗传图谱串联重复序列[1]。它们普遍存在和随机分布于大多数上[8~12]。真核生物的基因组中,重复数具有高频率的变异。这遗传多样性是一个需要用种、变种、亚种或品种的种专化位点的多态性可以十分容易地通过设计特异遗传变异来衡量其内部变异性的概念,遗传多样性为引物进行PCR扩增检测。由于SSR高水平的多态性、物种和个体的适应及进化提供原材料。利用DNA分容易检测和共显性等特点,使得它们成为一个丰富的子标记技

6、术可以有助于从本质上揭示物种遗传变异及遗传标记来源。目前含有约8000个位点的高饱和人其变异规律,而微卫星DNA标记技术是研究遗传多类微卫星图谱已经完成[2],一些哺乳动物的SSR遗传样性水平和居群间的相互关系及统计分析居群的遗传图谱也被构建。结构、等位基因频率以及居群间的遗传分化的优异的在植物系统中,Condit和Hubbel首先对5个热带分子标记之一,已被用于多种植物的遗传多样性研究。森林树种和玉米中的微卫星进行了研究,结果表明在1微卫星DNA标记的原理及特点[3]。随后,一些主要栽培1.1植物中同样存在丰富的微卫星微卫星DNA标记的基本原理植物中的

7、SSR类型及频率也相继被评价。大豆、水稻、微卫星DNA广泛存在于各种真核生物的基因组玉米和拟南芥中的SSR变异比其他分子标记如RFLP中,而且分布比较均匀[13]。鉴于微卫星DNA序列具有基金项目:湖北省科技攻关项目“金银花“中银一号”的选育及高产优质立体栽培模式的研究(2005AA201C53)。作者简介:杨进,男,1969年出生,湖北天门人,硕士学历,副教授;研究方向:植物生物技术,主持多项省市科研项目,发表科研论文近20篇。E-mail:jmyangjin@tom.com。收稿日期:2006-03-02,修回日期:2006-03-12。中国农学通报

8、第22卷第7期2006年7月农业生物技术科学http://www.casb.or

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