猪脂肪细胞决定和分化因子1基因_add1_中一个新snp的特性及其对肉质性状影响

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1、农业生物技术学报,2010年,第18卷,第4期,第725~731页JournalofAgriculturalBiotechnology,2010,Vol.18,No.4,725~731研究报告ALetter猪脂肪细胞决定和分化因子1基因(ADD1)中一个新SNP的特性及其对肉质性状影响1,22311*李长龙萨晓婴高会江孟和潘玉春1上海交通大学农业与生物学院动物科学系,上海200240;2浙江省医学科学院,浙江省实验动物中心,杭州310013;3中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京10193*通讯作者,panyc@sjtu.edu.cn摘要脂肪细胞决定和分化因子1(adipocytedeter

2、minationanddifferentiationfactor-1,ADD1)基因与人类和鼠的脂肪细胞分化具有确定的连锁关系。在脂肪细胞分化过程中,ADD1与转录因子PPARγ和C/EBP发挥着关键的作用。本研究克隆了保守DNA序列并用PCR-SSCP和直接测序法鉴定其多态性。同时,选择136头猪作为实验群体来探索其与肉质性状的关系。多态性分析发现:在第二外显子内一个导致错义突变的SNP,该SNP在实验群体内分布不平衡,未检测到AA基因型。相关分析结果显示,ADD1不同基因型间在肌内蛋白(MP)和肉色(MC)存在显著(P<0.05)的差异;肌内脂肪(IMF)存在极显著(P<0.01)的差异。

3、说明,ADD1基因多态性有可能应用到提高肉质的育种实践中。关键词猪,肉质,脂肪细胞决定和分化因子1基因(ADD1),PCR-SSCP,SNPCharacterizationofaNovelSNPofPorcineAdipocyteDeterminationandDifferentiationFactor-1Gene(ADD1)andItsEffectsonMeatQuality1,22311*LiChanglongSaXiaoyingGaoHuijiangMengHePanYuchun1DepartmentofAnimalScience,SchoolofAgriculture&Biology,

4、ShanghaiJiaotongUniversity,Shanghai200240,China;2ZhejiangAcademyofMedicalScience&ZhejiangCenterofLaboratoryAnimals,Hangzhou310013,China;3InstitutesofAnimalScience,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100193,China*Correspondingauthor,panyc@sjtu.edu.cnDOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2010.04.016Abs

5、tractAdipocytedeterminationanddfferentiationfactor-1gene(ADD1),ageneassociatedwithadipocytedifferentiationintheresearchofhumanandrat,playsaroleduringadipocytedifferentiationwithPPARγandC/EBP.Inthispaper,weclonedapartofthegenesequencefrompig,screeneditwithPCR-SSCP(singlestrandconformationpolymorphism

6、),andusedsequencingtoidentifymutation.TheresultindicatedthataSNP(singlenucleotidepolymorphism)happenedintheconservativedomainoftheADD1gene,whichledtoadifferentamino-acidsequenceandanewsiteforproteinase.Toveritytherelationshipbetweenthismutationandmeatquality,wechose136pigsastheexperimentalpopulation

7、,allofwhichwerebutcheredtodeterminemeatquality.TheresultofpolymorphismanalysisshowedthatanovelSNPwasfoundinsecondexon.ThepolymorphismwasdisequilibriuminpopulationandAAgenotypewasnotfoundinit.Therelati

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