水稻多逆境响应基因osmsr8的克隆与表达

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1、万方数据中国生态农重学报2010年5月第18卷第3期ChineseJournalofEco-Agriculture，May2010．18(3)：535-541DoI：lO．3724，SP．J．1011．2010．00535水稻多逆境响应基因OsMsr8的克隆与表达木黄梅1，2崔延春1，2朱玉兴1王曼玲1夏新界p。(1．中国科学院亚热带农业生态研究所长沙410125；2．中国科学院研究生院北京100049)摘要非生物胁迫是引起全世界作物减产的主要因素，利用分子生物学技术提高作物耐逆性已成为作物改良的新途径。本课题组采用Affymetrix

2、水稻表达芯片分析了超级稻亲本。培矮64S”全基因组表达模式，发现了众多逆境相关基因。OsMsr8基因受低温、干旱等多逆境因子诱导，在孕穗期干旱胁迫下表达水平显著上调。qRT-PCR分析试验数据与芯片结果基本吻合。利用生物信息学方法对所获得序列进行开放阅读框、序列同源性分析，预测了编码蛋白质产物的理化性质。该基因ORF全长为834bp，编码277个氨基酸残基，不舍内含子。无典型的基因保守结构域。在不同物种中有高相似性的蛋白，功能未知。对启动子区域进行分析，发现含有多种与逆境诱导相关的调控元件，推测该基因与植物耐逆性有一定关系．关键词水稻逆

3、境基因芯片实时定量PeR基因克隆中图分类号：Q344+．13文献标识码：A文章编号：1671．3990(2010)03．0535．07Cloningandexpressionofmulti-stressresponsivegene(OsMsr8)inriceHUANGMeil‘2，CUIYan．Chunl‘2，ZHUYu．Xin91，WANGMan—Lin91，XIAXin—Jiel(1．InstituteofSubtropicalAgriculture，ChineseAcademyofSciences，Changsha410125，C

4、hina；2．GraduateUniversityofChineseAcademyofSciences，Beijing100049，China)AbstractAbioticstressesconstituteaseriousthreattoagriculturalproduction，whichoftendevelopsintomajorcropproduction-reducingfactorsaroundtheworld．Molecularbiologytechnologyhas．however,emerged私apromisin

5、gvehicleimprovingcroptolerance．UsingGeneChipRiceGenomeArray(Affymetrix)toanalyzeglobalgenomeexpressionprofilingofparentsuperrice“Pei’ai64S”．weidentifiedalargenumberofstressresponsivegenes．OsMsr8，whichrespondstodroughtandcoldstresses，ishighlyinducedinricepanicle．Quantitat

6、ivereal·timePCR(qRT-PCR)dataarewellinsyncwithmicro-arrayresults．Bio-informaticmethodswereappliedtOanalyzethegenesequenceanditsproteinproduction，includingORF，homologoussequences，andphysicalandchemicalproperties．Theresultsshowthegenewitha834bpopenreadingfianleandencoding27

7、7aminoacids．OsMsr8genelacksintronandtypicalconserveddomainsinitsproteins．Alsounknownhomologousproteinsexistinthedifferentspecies．Analysisofputativepromoterregionidentifiesseveralregulatoryelementsrelatedtostressresponse．OsMsr8mightthereforebemuchrelatedtoricestresstolera

8、nce．KeywordsOryzasativaL．，Stress，GeneChip，Real—timePCR，Genecloning(ReceivedAug．1l，2009；acceptedNov．13，2