花尾榛鸡的系统地位与blb基因多态性研究

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1、万方数据学校代码：10225学号：S13404学位论文花尾榛鸡的系统地位与BLB基因多态性研究指导教师姓名：申请学位级别：论文提交日期：授予学位单位：白素英硕士2013．04蔡晓淇东北林业大学学科专业：动物遗传育种与繁殖论文答辩日期：2013．06．15授予学位日期：答辩委员会主席：论文评阅人：春J／,-韶5-t犬q,万方数据UniversityCode：10225RegisterCode：S13404DissertationfortheDegreeofMasterStudiesonSystematicsandBLBGenel'olymorphismoftheH

2、azelGrouse(TetrastesBonasia)Candidate：Supervisor：AssociateSupervisor：AcademicDegreeAppliedfor：Speciality：DateofOralExamination：University：CaiXiaoqiBaiSuying，AssociateProfessorMasterAnimalGenetiesBreeding＆ReproductionJune，2013NortheastForestry吣6呲2㈣4㈣m呲2㈣盯㈣Y万方数据摘要花尾榛鸡(Tetrastesbonasia)

3、是松鸡科鸟类中分布最广、最为常见的一个种。花尾榛鸡的分类地位一直存在争议，目前，从分子水平上专门对花尾榛鸡系统地位的研究还未见报道。花尾榛鸡由于肉味鲜美深得人们青睐，因野生数量减少已被列为国家二级保护动物，但其人工驯养繁殖中存在繁殖率低、幼雏成活率低和对疾病的易感性等问题，而MHC基因与抗病性和繁殖力都有很大的相关性，因此，对花尾榛鸡BLB基因多态性进行研究必要而可行。本研究首先通过实验获得花尾榛鸡和黑琴鸡的COI序列，并从Genbank中下载松鸡科17个物种的12SrRNA、Cytb、ND2序列和13个物种的COI序列，通过单基因和多基因整合序列从分子水平探讨

4、花尾榛鸡的系统地位。其次，对花尾榛鸡33个个体BLB基因的exon2进行PCR扩增，采用克隆测序的方法进行序列测定，并利用生物软件对所获得的核苷酸序列进行分析，结果如下：l、依据12SrRNA、Cytb和COI基因序列和四个基因的整合序列的系统发育分析结果，本研究支持将花尾榛鸡划入松鸡科(Tetraonidae)榛鸡属(Tetrastes)，即支持Tetrastes属有效。2、对比单基因和整合数据的结果，所选择的4个基因中，COI基因更适合松鸡科鸟类的系统发生关系研究。3、从33个个体中得到234条克隆序列，比对分析后得到13个等位基因序列。核苷酸突变分析表明，

5、花尾榛鸡13个BLB等位基因的突变主要以颠换为主。平均非同义替换率dn(0．111)与平均同义替换率ds(O．096)的比值为1．156，大于1，表现为正向选择。4、利用BLB外显子2序列对花尾榛鸡种群进行遗传多样性分析，结果显示，该种群的遗传多样性偏低，暗示该物种的抗病能力较弱。5、根据进化树、Network网络图以及个体基因型显示，花尾榛鸡可能存在至少3个BLB座位；在鸟类MHC的BLB中存在着基因重复事件。6、构建的鸡形目10种鸟类的BLB进化树显示，所分析雉科中红腹锦鸡和环颈雉的BLB与松鸡科鸟类BLB的进化关系较近；BLB在鸡形目鸟类科间及科内都存在跨

6、物种进化现象。关键词花尾榛鸡、系统地位、BLB、遗传多态性、跨物种进化万方数据AbstractmhazelgrouSe(Tetrastesbonasia)isthemostwidelydistributedandthemostcommonspeciesofTetraonidae．Thetaxonomicstatusofhazelgrousehasbeencontroversial．Sofarithasnotbeenreportedthatthespecialresearchofsystematicsofhazelgrouseatthemolecularlevel

7、．Becauseofitsdeliciousmeatanddecreasingpopulation，ThehazelgrousehasbeenlistedasasecondclassprotectedanimalinChina．Butitsdomesticationandcaptivebreedinghassomeproblems，suchaslowreproductiverate，survivalrateanddiseasesusceptibility．MHCgeneshaveasignificaticantcorrelationwithdisbeaseres

8、istanceandfe