apob基因多态性研究的意义

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1、1.材料和方法1.1材料EcoRI、PCR扩增引物序列均参照GajraB等[1],MspI位点的PCR扩增引物序列参照SoriaLF[2],3'VNTR的PCR扩增引物序列参照罗超权等[3],引物的序列如下(由上海铂尚生物技术公司合成):EcoRI5’primer:CTGAGAGAAGTGTCTTCGAAG3’primer:CTCGAAAGGAAGTGTAATCACMspI5’primer:CTGAGAGAAGTGTCTTCGAAG3’primer:CTCGAAAGGAAGTGTAATCAC3'VNTR5’primer:CTGAGAGAAGTGTCTTCGAAG3’p

2、rimer:CTCGAAAGGAAGTGTAATCAC模板DNA:健康人口腔黏膜上皮细胞16份(来源随机抽取健康...)PCRMIX(Taq1.25U,dNTP各0.4mM,2×PCRBuffer)EcoRI酶切体系(10µlPCR产物、18µl双蒸水、2µlEcoRI酶切Buffer、1µlEcoRI限制内切酶(10U/µl))MspI酶切体系(10µlPCR产物、18µl双蒸水、2µlMspI酶切Buffer、1µlMspI限制内切酶(10U/µl))dNTP、抽提缓冲液(100mMTris,50mMEDTA,200mMNaCl,0.5%SDS,200ug/ml蛋

3、白酶K,pH8.0)、酚:氯仿(1:1)、氯仿:异戊醇(24:1)、乙醇、70%乙醇、TE缓冲液仪器:凝胶成像系统、BG-Power300电泳仪、ZD-600标准水箱、小型台式告诉冷冻离心机、Hema3200基因扩增仪、0826微型离心机1.2方法1.2.1口腔粘膜上皮细胞基因组DNA的提取将生理盐水漱口液10ml转移至15ml离心管,8000rpm离心10min。倒出上清,管内白色沉淀即为口腔粘膜上皮细胞。用酚/氯仿提取法从外周白细胞提取基因组DNA:将口腔粘膜上皮细胞细胞重悬于0.5ml抽提缓冲液,65℃水浴30分钟,依次加入等体积的酚:氯仿(1:1)和氯仿:异戊

4、醇(24:1),分别抽提1次。DNA用乙醇洗淀并经70%乙醇洗涤后室温干燥,加入适量TE缓冲液溶解,-20℃保存备用。1.2.2PCR扩增PCR扩增反应体系如上,扩增程序分别如下:EcoRI:94℃预变性7min;94℃变性1min,58℃复性与延伸3min,进行30个循环;最后72℃再延伸5min。MspI:94℃预变性7min;94℃变性1min,60℃复性1min,72℃延伸1min,进行30个循环;最后72℃再延伸5min。3'VNTR:94℃预变性7min,94℃变性1min,60℃退火及延伸共4min,进行30个循环,最后60℃再延伸10min。thepr

5、ovisionsofelectricpowerconstructionengineeringqualitysupervisionandquality...2.4.1.1theunitworksacceptancerateof100%,thequalityevaluationofatotalscoreof95orabove;2.4.1.2regulatedWeldingNDTinspection100%,regulatedweldingapassingrateof>99%,andweldbeadappearance;2.4.1.3boilerhydraulic1.2.3

6、基因多态性的检测与分型EcoRI酶切位点:通过PCR-RFLP技术检测,先建立31µl酶切体系,混匀后37℃酶切12小时,65℃加热20min终止反应。2%琼脂糖凝胶电泳分离酶切产物,凝胶成像仪拍照电泳结果。MspI酶切位点:通过PCR-RFLP技术检测,先建立31µl酶切体系,混匀后37℃酶切12小时,80℃加热20min终止反应。2%琼脂糖凝胶电泳分离酶切产物,凝胶成像仪拍照电泳结果。3'VNTR:PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳分离,凝胶成像仪拍照电泳结果,然后通过软件计算PCR产物的分子量。apoB3'VNTR序列由两端152个保守序列和中间以15bp核心序列多

7、次重复组成,核心序列重复次数由以下公式估算获得:(扩增片段bp数—152bp)/15bp。2.结果2.1apoB3’VNTR多态性16个样本DNA经扩增后均出现1-2条带(纯合子为1条带,杂合子为2条带),其中11个样本为杂合子,5个样本为纯合子。共检出片段大小不同的21条带(如图1)。以15bp为一重复单位,重复次数为31-57次。其中以35-36次较多,占40.7%(见图2)。而38次以上和32次以下出现频率较低。图1.apoB基因VNTR电泳图theprovisionsofelectricpowerconstructionengineering

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