木霉aflp分子标记技术体系的建立

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1、第49卷第1期湖北农业科学Vol.49No.120第101年期1月HubeiAgriculturalSciencesJan.,2010木霉AFLP分子标记技术体系的建立黄玉杰1211,3111,PAULHarvey,李纪顺,杨合同,吴远征,任艳,周红姿(1.山东省科学院中日友好生物技术研究中心/山东省应用微生物重点实验室,济南250014;2.澳大利亚联邦科学院昆虫研究所,阿德来德5064;3.山东理工大学生命科学学院,山东淄博255049)摘要:以摇床培养的木霉菌丝为材料,采用液氮研磨等方法提取到高

2、质量的基因组DNA,能够用于AFLP实验分析,探索和优化酶切-连接反应、预扩增和选择性扩增反应过程中的关键因素,建立了适合木霉AFLP的最佳试验体系和反应条件。利用该技术体系对不同时期保存的菌株及融合子进行AFLP指纹分析,发现不同时期保存的同一菌株指纹相同,融合子指纹兼有亲本菌株的特性。通过对木霉AFLP条件的探索和研究,建立了木霉基因组AFLP反应体系,得到的扩增多态性条带完全能够用于木霉遗传稳定性和多样性分析。关键词:木霉;AFLP;分子标记;反应体系中图分类号:S154.3;Q933文献标识码

3、:A文章编号:0439-8114(2010)01-0017-04TheEstablishmentofAFLPMarkersTechnicalSystemforTrichodermaspp.HUANGYu-jie1,PAULHarvey2,LIJi-shun1,YANGHe-tong1,3,WUYuan-zheng1,RENYan1,ZHOUHong-zi1(1.BiologyResearchInstitute,ShandongAcademyofSciences,Jinan250014,China;2.

4、EntomologyInstitute,AustralianCommonwealthScientificandResearchOrganization,Adelaide5064,Australia;3.CollegeofLifeandSciences,ShandongUniversityofTechnology,Zibo255049,Shandong,China)Abstract:Inordertoprovideabasisforidentificationanddiversityanalysisof

5、Trichodermaspp.throughAFLPreactionsystem,improvedmethodwasusedtoextracthighqualitygenomicDNAwithhyphafromTrichodermaspp.throughliquidnitrogenrubbing,whichcouldbeusedinamplifiedfragmentlengthpolymorphism(AFLP)analysis.Thekeyfactorswereexploredandoptimize

6、damongenzyme-digestedreaction,ligation,pre-amplificationandselectiveamplification.AFLPfingerprintingofstrainsstoredindifferentperiodsandthefusionswasanalysedwiththissystem.Theresultsshowedthatthefingerprintingofthesamestrainindifferentperiodswasthesame,

7、andthefingerprintingofthefusionshadthecharactersfromtheparents.Therefore,itwasausefultooltoresearchtheidentificationandgeneticdiversityinTrichodermaspp.throughoptimizedAFLPsystem.Keywords:Trichodermaspp.;AFLP;molecularmarker;reactionsystem扩增片段长度多态性(Ampl

8、ifiedfragment的重要组成群落之一[3]。该菌易于分离培养、生长迅lengthpolymorphism,AFLP)分子标记技术是1992速,可以产生葡聚糖酶、几丁质酶及蛋白酶等多种年由荷兰科学家Zabeau和Vos发明的,并获得了欧酶类[4],对多种病原真菌具有拮抗作用,同时能够促洲专利[1,2]进植物生长,诱导其产生抗性,是一类重要的植物。该技术结合了RFLP和PCR的优点,具有灵敏度高、稳定性好和可靠性强等优点,被认为病害生防菌[5]。目前

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