石蒜属植物遗传多样性的issr和rapd标记比较研究

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1、中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第38卷第10期2007年10月·1555·石蒜属植物遗传多样性的ISSR和RAPD标记比较研究1,22221,23X袁菊红,孙视,彭峰,冯煦,夏冰(11南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;21江苏省中国科学院植物研究所南京中山植物园,江苏南京210014)摘要:目的研究石蒜属4种植物的种间亲缘关系和同一种内不同采集地材料的遗传多样性,为其种质资源评价和合理开发利用提供分子佐证。方法用ISSR和RAPD标记分别对不同采集地的

2、37份石蒜属植物(石蒜18份、中国石蒜10份、换锦花5份、忽地笑4份)的基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果(1)16条ISSR和17条RAPD引物分别扩增出229和215条带,多态比率分别为85159%和69177%,显然,ISSR检测出的多态性条带的能力优于RAPD;(2)ISSR和RAPD标记检测同组供试材料种间或种内的Nei′s遗传相似系数范围分别为015459～019345,016419～110000,平均为016836,017428。两者相关系数r=018582,达极显著水平。(3)IS

3、SR和RAPD标记的分子聚类结果相近,两种标记均能准确地把不同来源的材料先按种聚类,种间的分子分类结果与传统经典分类相符;种内不同采集地材料间存在一定的遗传差异,其遗传多样性较为丰富。(4)用POPGENE312分析的种间基因分化系数(Gst)与用AMOVA进行的遗传变异巢式方差分析所得结果基本一致。结论两种标记均可用于石蒜属植物种间亲缘关系与种内的遗传多样性研究,虽然ISSR标记在种间遗传多样性检测上分辨力较RAPD标记低,但ISSR标记能检测到更高的种内遗传差异性,更适合种下水平的遗传多样性研究。

4、关键词:石蒜属;RAPD;ISSR;种间差异;遗传多样性中图分类号:R2821710文献标识码:A文章编号:0253-2670(2007)10-1555-07ComparisonbetweenISSRandRAPDmarkersingeneticdiversityofplantsinLycorisHerb11,2221,22YUANJu2hong,SUNShi,PENGFeng,XIABing,FENGXu(11CollegeofHorticulture,NanjingAgriculturalUniv

5、ersity,Nanjing210095,China;21InstituteofBotany,JiangsuProvinceandChineseAcademyofScience,NanjingBotanicalGarden,Mem.SunYat2SenNanjing210014,China)Abstract:ObjectiveToinvestigatetheinter2andintra2specificrelationshipsamongfourspeciesofLycorisHerb1fromdif

6、ferenthabitatsandprovidetheevidencefortheevaluationandexploitationofthegermplasmofLycorisHerb1MethodsThegeneticdiversitiesof37accessionsofLycorisHerb1fromdif2ferenthabitatswereinvestigatedwiththetechniqueofinter2simplesequencerepeat(ISSR)andrandomamplif

7、iedpolymorphicDNA(RAPD),whichwere18ofL1radiate,10ofL1chinensis,5ofL1sprengeriand4ofL1aurea1Results(1)The229and215DNAbandswereamplifiedwith16ISSRand17RAPDprimersrespectively,thepercentageofpolymorphicbands(PPB)inISSRdetection(85159%)washigherthanthatinRA

8、PD(69177%)1(2)Thecoefficientrangesofinterspecificandintraspecificgeneticsimilari2ty(GS)inISSRandRAPDanalysesforthesamematerialswere015459-019345and016419-110000,respectively,theaveragewere016836and0174281Therewassignificantdiffer