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《[生物学]杜鹃花属植物的rapd标记研究》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、Y783678分类号:S685.210949.7723学号:S200218Q(的四川农业大学硕士学位论文杜鹃花属植物的RAPD标记研究段国锋指导教师:肖千文副教授胤主英副教授学科专业:森林培育学研究方向.经济林培育摘要本研究对RAPD-PCR的反应体系进行了优化,并利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对24种杜鹃花属(Rhododendron)植物进行基因组多态性分析。共筛选了60个随机引物,其中4个随机引物的扩增产物多态性明显,获得清晰重复性好的条带。在NTSYS-pc软件中,统计扩增产物条带数,用来计算Jaccard遗传相似系数和遗传距离,建
2、立UMPGA聚类分析图。结果表明:1.获得较好的反应程序和反应体系为:反应程序为:95°C预变性lmin;94PC变性lmin;34t)退火lrain;72°0延伸2min:45个循环;72*0延伸5rain;保存。反应体系(20W反应体系)为:模板DNA(10ngM)L5^1;10XPCRbuffer如1;Taq酶(0.5_)0.3W;Primer(0,8Pmol/W)4W;MgCl2(25mmol/L)1.8W;dNTPs(dATP、dCTP、dTTP、dGTP各含1.ONmol/W)0.6rt。2.随机引物P15、U7、U10和X3四个引物对24
3、种杜鹃花属(RhododendronL.)植物扩增的条带在10〜15之间,多态性条带在9〜14条之间,平均每条引物扩增出12条带;引物U10是扩增出多态性最多的引物,多态性占93.33%。3.用4个随机引物对24种杜鹃花属植物进行RAPD扩增,所得产物显示了丰富的多态性,表明杜鹃花属植物种间遗传基础相当复杂;对RAPD产物进行统计的相似系数分析和聚类分析结果同形态分类学基本吻合,说明RAPD技术在杜鹃花属楦物种间划分和鉴定上有很髙的灵敏性和准确性。总的来说,利用RAPD技术可以为杜鹃花属植物的系统演化和划分研究提供帮助。关键词:杜鹃花属;RAPD;聚类
4、分析;遗传多样性AbstractThereactionCondiactionsfortheRandomlyAmplifiedPolymorphicDNA(RAPD)analysisforRhododendronhavebeenoptimizedandanalyzedtheGeneticRelationshipsAmong24RhododendronusingRAPDmarkers.Fourout60randomprimerswereselectedwhichproducteddistinctbands,showingunmistakablepolymo
5、rphism.ByNTSY-PCprogram,Jaccard’sgeneticsimilaritycoefficientsweregeneratedanddendromgramwasconstructedusingUMPGA.Theresultswereasfellow:1)ThePCRproductswerestablewhenthePCRwas45cyclesofpredenatureat95°Cfor1minutes,denature94#C1minutes,annealing34*C1minutes,extension72#C2minutes
6、.Finally,itextenst725minutes,andstoredat4°C.Theamplificationsolution(20fil)wasconsistedofdNTPs0.6^il,lO^PCRbuffer2)il,MgCb(25mmol/L)1.8^1,TaqDNApolymerase(0.5U/^I)0.3
7、il,Primer(0.8Pm/nl)4^l,templateDNA(lOng/pl)12)Thepolymorphismanalysisshowedatotalof48bands,amongwhich44werepolym
8、oiphic.Perprimerproducted12bands,including11polymorphicbands.PrimerU10attainedthemostpolymoiphicbandsamongthefourprimers,polymorphicratereach93.33%.3)ThePCRproductsusingthefourrandomprimersamplified24accessionDNAofRhododendronshowedthecomplexgeneticbaseintheGeneticRelationships.
9、Theclusteringresultsaccordingtogeneticsimilarit