猪背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达和主成分分析

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1、ISSN100727626中国生物化学与分子生物学报2008年1月CN1123870PQChineseJournalofBiochemistryandMolecularBiology24(1):46~54猪背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的差异表达和主成分分析1)1)31)2)2)1)1)李明洲,李学伟,朱砺,滕晓坤,肖华胜,李强,陈磊(1)2)四川农业大学动物科技学院,雅安625014;生物芯片上海国家工程研究中心,上海201203)摘要骨骼肌细胞和脂肪细胞在分化生长速度上相对竞争的平衡点是猪肉质和胴体性状的决定因素.利用O

2、ligo功能分类芯片检测了瘦肉型的长白猪和脂肪型的太湖猪在初生、1、2、3、4和5月龄间背最长肌中肌肉生长和脂肪沉积相关基因的动态表达变化.差异表达分析结果显示,在初生至5月龄的品种间分别有15、16、11、13、18和20个基因的表达差异倍数大于2倍.品种内的方差分析表明,长白猪分别有18和22个基因,太湖猪分别有3和7个基因在月龄间的表达差异达极显著(P<0101)和显著水平(P<0105).主成分分析结果显示,先降后升是两品种内最具代表性的基因表达模式,且长白猪和太湖猪分别有7和6个基因的表达模式明显偏离其他基因,提示其可能

3、受到了重要的调控.此外,5个差异表达基因的荧光定量RT2PCR验证结果均与芯片结果呈正相关趋势.以上结果筛选出了对于猪肉质和胴体性状可能具有重要影响,值得深入研究的一些候选基因,为深入研究生长发育过程中参与肌纤维生长和脂肪酸合成关键基因的表达变化规律和互作调控机制提供了基础数据.关键词猪;基因芯片;肌肉;脂肪;基因差异表达;主成分分析中图分类号Q756DifferentialExpressionandPrincipalComponentAnalysisofGenesRelatedtoMuscleGrowthandAdiposeDe

4、positioninPorcineLongissimusDorsiMuscle1)1)31)2)2)LIMing2Zhou,LIXue2Wei,ZHULi,TENGXiao2Kun,XIAOHua2Sheng,1)1)LIQiang,CHENLei(1)CollegeofAnimalScienceandTechnology,SichuanAgriculturalUniversity,Ya’an625014,Sichuan,China;2)NationalEngineeringCenterforBiochipatShanghai,S

5、hanghai201203,China)AbstractThecompetitiveequilibriumofgrowthrateofskeletalmusclecellsandadiposecellsdeterminesporcinemeatqualityandcarcasstraitssimultaneously.Theexpressionchangesofgenesassociatedwithmusclegrowthandadiposedepositioninlongissimusdorsimuscleatsixgrowth

6、stages(birth,1,2,3,4and5months)ofLandraceandTaihupigswereexaminedbyusingpathway2focusedOligomicroarray.Thecomparativeresultsofchangeratiosbetweentwopigbreedsshowedthatthefoldchangesof15,16,11,13,收稿日期:2007208202,接受日期:2007209226教育部长江学者和创新团队发展计划项目(No.IRT055526)、教育部高等学校博士

7、学科点专项基金项目(No.20060626003)、四川省教育厅自然科学重点科研项目(No.2006D004)和四川省教育厅青年基金项目(No.2006B004)资助3联系人Tel:083522886000,E2mail:lixuewei9125@126.comReceived:August2,2007;Accepted:September26,2007SupportedbyProgramforChangjiangScholarsandInnovativeResearchTeaminUniversityofChineseMinis

8、tryofEducation(No.IRT055526),SpecializedResearchFundfortheDoctoralProgramofHigherEducationofChina(No.20060626003),MajorProje

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