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《草菇子实体不同成熟阶段的比较蛋白质组学分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、菌物学报jwxt@im.ac.cn15January2014,33(1):55‐68Http://journals.im.ac.cnMycosystemaISSN1672‐6472CN11‐5180/Q©2014IMCAS,allrightsreserved.研究论文ResearchpaperDOI:10.13346/j.mycosystema.120233草菇子实体不同成熟阶段的比较蛋白质组学分析122*22刘靖宇江玉姬谢宝贵陈炳智严俊杰1山西农业大学食品科学与工程学院山西太谷0308012福建农林大学菌物研究
2、中心福建福州350002摘要:采用iTRAQ标记结合二维液相色谱串联质谱技术对草菇不同成熟阶段的差异蛋白质组进行研究。首先将提取的草菇不同成熟阶段蛋白样品进行SDS‐PAGE分析,其次将经二维液相色谱串联质谱技术获取的串联质谱数据通过MASCOT软件搜库,之后对鉴定蛋白质数据进行了KEGG代谢通路分析。试验共计获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白质,其中1030个蛋白质具有定量信息。与蛋形期相比,在伸长期和成熟期阶段显著上调蛋白质85个,下调蛋白质103个。KEGG代谢通路分析结果显示,草菇不同成熟阶段中
3、的68个差异蛋白质可定位于4种伞菌目模式真菌(灰盖鬼伞、双色蜡蘑、可可丛枝病菌和裂褶菌)的45个不同生物代谢途径,全景展示出草菇成熟阶段差异表达蛋白质定位的代谢网络。结果表明,iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可对不同生长发育时期的草菇蛋白样品进行有效地分离和鉴定。关键词:草菇,KEGG代谢通路分析,iTRAQ标记,二维液相色谱串联质谱AcomparativeproteomeanalysisofVolvariellavolvaceafruit‐bodiesdevelopedatdifferentstage
4、s122*22LIUJing‐YuJIANGYu‐JiXIEBao‐GuiCHENBing‐ZhiYANJun‐Jie1CollegeofFoodScienceandEngineering,ShanxiAgriculturalUniversity,Taigu,Shanxi030801,China2MycologicalResearchCenterofFujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou,Fujian350002,ChinaAbstract:Thisworkwa
5、sdesignedtoinvestigatedifferentialexpressionproteinsatdifferentmaturestagesofVolvariellavolvaceausingisobarictagsforrelativeandabsolutequantification(iTRAQ)‐coupledtwo‐dimensionalliquidchromatog‐raphytandemmassspectrometry(2DLC‐MS/MS)proteomicsapproach.Thepro
6、teinsextractedfromV.volvaceaatdif‐ferentmaturestageswereanalyzedbySDS‐PAGE.Afterthat,thetandemmassspectrometrydataobtainedfrom2D基金项目:山西农业大学科研启动基金(No.xb2012019);国家自然科学基金(No.31301826);国家现代农业产业技术体系建设专项资金(No.CARS24);草菇育种岗位资助*Correspondingauthor.E‐mail:mrcfafu@163
7、.com收稿日期:2012‐11‐10,接受日期:2013‐02‐0656ISSN1672‐6472CN11‐5180/QMycosystemaJanuary15,2014Vol.33No.1LC‐MS/MSwereusedtosearchusingMASCOTsearchengine.ThefunctionalanalysisofdifferentialexpressionproteinswasconductedusingKEGG.Resultsshowedthat1039proteingroups,inclu
8、dedatotalof2335uniquepeptides,wereidentified.Amongthem,1030proteingroupswereprovidedquantitativeinformation.Comparedwitheggstage,85up‐regulatedand103down‐regulatedsignificantlydifferentia