中药方剂龙蛇羊泉汤的计算药理学研究

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1、AthesissubmittedtoZhengzhouUniversityforthedegreeofMasterTheComputationalPharmacologyStudyonTraditionalChineseMedicineLongSheYangQuanDecoctionforTumorByXiaojuanYuSupervisor：Prof．ShunXuMedicinalChemistryTheCollegeofChemistryandMolecularEngineeringMay2014学位论文原创性声明本人郑重声明：

2、所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均己在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。学位论文作者：亏心‰日期年月日学位论文使用授权声明本人在导师指导下完成的论文及相关的职务作品，知识产权归属郑州大学。根据郑州大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅：本人授权郑州大学可以将本学位论文的全部或部分编入有关数

3、据库进行检索，可以采用影印、缩印或者其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。本人离校后发表、使用学位论文或与该学位论文直接相关的学术论文或成果时，第一署名单位仍然为郑州大学。保密论文在解密后应遵守此规定。学术论文作者：弓上鲰日期：年月日摘要癌症，是死亡率极高的疾病之一，长期威胁人类健康，因此癌症的预防与治疗将成为迫切需要解决的问题。然而，中药治疗癌症，能够针对病源，明显缓解症状，减少病人痛苦。中药方剂龙蛇羊泉汤是由前人在治疗癌症的过程中总结出的一个抗癌复方，由龙葵、蛇莓、白英、海金沙、灯芯草和土茯苓等中药组成，主要应用于肿瘤疾病的治疗

4、，对膀胱癌的治疗效果尤其显著。本文主要利用计算化学的方法对中药方剂龙蛇羊泉汤进行了研究，包括以下三部分：第一，通过查阅文献得到龙蛇羊泉汤中己知的有424种化合物小分子，利用软件Cerius2中的QSAR模块计算其化学描述符，并对描述符进行分析，发现均符合Lipinski五规则，表明龙蛇羊泉汤中所含的化学成分大部分都具有成药的药代动力学性质。通过主成分分析研究，发现424种小分子和142种抗癌药物／类药分子在化学空间中的分布有较大的重叠，表明中药方剂龙蛇羊泉汤中可能含有治疗肿瘤疾病的活性成分，为接下来的虚拟筛选工作打下良好的基础。第二

5、，虚拟筛选。首先，通过软件Cerius2进行LigandFit对接，将龙蛇羊泉汤中含有的424种小分子同24种与癌症有关的蛋白质靶标(37个结合位点)对接，以原配体对接得分作为阈值筛选出具有活性的化合物小分子。其次，利用软件Pajek构建了小分子．蛋白质网络图，对化合物分子活性进行分析，发现筛选出的活性成分在整个网络中起到了重要作用。利用软件CintiBin计算Degree和Betweeness值，其值较大表明其在整个网络中发挥的作用较强。以此筛选出了13种活性成分，其中有12种为黄酮类化合物，然而黄酮类化合物已经被报道具有抗癌活性

6、，表明13种化合物很可能是中药方剂龙蛇羊泉汤中的活性成分。第三，精细对接。利用软件AutoDock对以上筛选出的13种具有较强活性的小分子与部分受体分子做进一步对接，通过研究配体与受体间的具体结合模式，我们发现了配体分子中起关键性作用的结构及基团，龙蛇羊泉汤中黄酮类化合物在治疗癌症方面起到了重要作用。通过对接结果的分析，印证虚拟筛选结果的正确性，并为新药的研发与设计提供指导。关键词：龙蛇羊泉汤：抗癌：分子对接；虚拟筛选，计算药理学。AbstractCancer，whichisathreattohumanhealth，isoneoft

7、heveryhighmortalityrateofthedisease．Therefore，preventionandtreatmentofcancerwillbecomeanurgentproblemtobesolved．However,traditionalChinesemedicinecanrelievesymptomsandreducethepainofpatientsaccordingtothediseasesourcesinthetreatmentofcancer．ThetraditionalChinesemedicin

8、eprescriptionLongSheYangQuanDecoctionwasscreenedoutbypredecessors，whichisaprescriptionforcancer扛eatmengandconsistsofs