基于数据降维技术的全基因组区域化关联分析统计推断方法研究

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1、●7j乏．琴I．‘厶百蝴＆wz法久删7，二缈C九砂7，渺劲删咖D7驯弘伽鲫移作者专业导师合作导师西Jf年j月2争日器登蜘●立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。论文作者签名：关于学位论文使用授权的声明本人完全了解山东大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅；本人授权山东大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可

2、以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。(保密论文在解密后应遵守此规定)论文作者签一师签名i簪期：碹!』：』：子g．●士学位论文CoNTENTSAbstract⋯．⋯⋯．．⋯⋯．．⋯⋯⋯．．⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯．．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．．⋯⋯．．．1Abbreviati01：l⋯⋯．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．．．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．．⋯⋯．⋯⋯．⋯⋯．⋯．．⋯．⋯⋯．．!；Background⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．6ChapterlAnewmethodtote

3、stthenonlinearfeatureinnonlinearprincipalcomponentanalysis⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．11In订oduction⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．⋯．．⋯⋯⋯．11Methods⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．⋯．⋯⋯．⋯．．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．⋯⋯．⋯．⋯．．12PCA⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．．⋯．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．⋯⋯．．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．⋯．⋯．．12K-meanscluster⋯．．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．

4、．⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯12Nonlinearitymoasul'e⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．—。⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．12Examples⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．15Linearexample⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．15Nonlinearexample⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯16Realdata⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯17Discussioll⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯19Chapter2Gene-orregion-basedassociationstudyviakernelprincipalcomponentanalysis⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．?：⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．21Imroduction⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．：!lMethods⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯23PCA．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯

6、⋯．⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯．⋯⋯．⋯⋯⋯．⋯．．．23KPCA⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．23Logisticregressiontest⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．25Datasimulation⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．⋯⋯⋯⋯．⋯．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯26Application⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．．⋯．．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．⋯．⋯．．⋯⋯⋯．．⋯⋯．．27Results⋯⋯．．⋯⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．．⋯⋯⋯⋯．⋯．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯．．⋯⋯⋯．

7、⋯⋯．．．27DatasimulatiorI⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．：17Application⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．31Discussion⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．31Conclusion⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．33Chapter3Exhaustivesliding-windowscanapproachforgenom争wideassociationstudyviaPC

8、A-bas