圈养大熊猫食性转换期肠道菌群的多样性研究

《圈养大熊猫食性转换期肠道菌群的多样性研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、万方数据论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：男永久幻f惦年‘月¨日关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学

2、位论文。同意四川农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名：导师签名驾永久?of呤年b月11日如7IP年6月11曰基金项目万方数据IRillIlllllllllUliiiIIIJO121412国家自然基金面上项目大熊猫国际合作资金项目(SD0632)万方数据摘要食性转换期是大熊猫一生中的重要时期。圈养条件下，10月龄左右的亚成年大熊猫进入食性转换期，该阶段是大熊猫由高蛋白饮食(如母乳或牛奶等)向以竹类等高纤维素食物为主食的转化过程。一些研究己证明食物的转换会影响肠道微生物的组成以及宿主的抵抗力，并且大熊猫肠道菌群在降解含高纤维素的竹子中扮演了重要的

3、角色。为了探究圈养大熊猫食性转换期肠道菌群的多样性，本实验采用ERiC—PCR指纹图谱技术筛选出肠道菌群多样性高的样品，并对筛选出来的样品构建16SrDNA克隆文库，采用限制性内切酶HinfI和MspI对其进行RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)及测序分析。研究结果如下：1．对3只大熊猫在食性转换期的粪便细菌总DNA进行ERIC—PCR指纹图谱分析，通过图谱相似性及多样性筛选出多样性较高的样品(F6、F7、G8、J9、G10、J11、J12)。2．通过构建食性转换期大熊猫肠道菌群的克隆文库及对文库进行RFLP分析，共获得787个阳性克隆

4、子，产生224个OTUs。构建的文库覆盖率都大于78．5％，说明所构建的克隆文库具有良好的代表性。Shannonindex(H’)，Simpsonindex(1／D)，SChaol(S)三个多样性指数都表明食性转换期大熊猫肠道菌群多样性丰富，且食性转换前期和食性转换后期大熊猫肠道菌群的多样性高于食性转换中期。3．16SrDNA序列分析发现食性转换期大熊猫肠道菌群归为硬壁茵门、变形菌门、拟杆菌门、梭形杆菌以及未培养细菌。其中硬壁菌门和变形菌门是大熊猫整个食性转换期的优势菌群。在大熊猫食性转换期中，482个序列属于＆一，丫一和￡．变形菌门(在整个序列中占61．25％)，并且这些序列归为17

5、个细菌属。241个序列属于硬壁菌门(在整个序列中占30．62％)，并分布在10个细菌属中。它们随着食性的转换其比例也发生变化。在硬壁菌门中，优势菌群是梭菌属和球菌属；在变形菌门中，优势菌群是埃希氏菌属和醋杆菌属。关键词：大熊猫；食性转换期；菌群多样性；粪便万方数据CharacterizationoftheBacterialDiversityinFaecesfromCaptiveGiantPandaduringDietConversionPeriodYongjiuLuo(ClinicalVeteribaryMedicine)DirectedbyGuangnengPengandZhijun

6、ZhongABSTRACTDietconversionperiodisaspecialstageforgiantpanda．Incaptiveconditions，thesubadultpanda’Sthatv／astenmonthsoldenterthedietconversionperiod．Duringthisperiod，giantpandaneedadapttohighlyfibrousbambooastheirmainfoodfromhigh—proteindietandformaspecialdigestionsystemtodigestcelluloseandhemic

7、ellulose．Otherstudiesprovedthatdietalterationsaffectintestinalmicrobiotacompositionandhostresistance．IntestinalmicrobiotasplayakeyroleforgiantpandatOdigesthighlyfibrousbamboo．Inordertoexplorethediversityofintestinalbacterium