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《基于生物信息学与生物技术开发植物分子标记的研究进展》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、分子植物育种，2009年，第7卷，第1期，第130-136页MolecularPlantBreeding,2009,Vol.7,No.1,130-136专题介绍Review基于生物信息学与生物技术开发植物分子标记的研究进展张征锋1肖本泽2*1华中师范大学遗传调控与整合生物学湖北省重点实验室,武汉,430079;2华中农业大学植物科学与技术学院,武汉,430070*通讯作者,benzexiao@mail.hzau.edu.cn摘要各种序列数据库的迅猛增长与生物信息软件的不断开发使基于序列资源的标记开发更加便捷，各类分子生物学技术的涌现及高通量检测平台的建设为实验室开发分子标记
2、提供了强有力的技术支持。本文从生物信息学角度概述了SNP、SSR等分子标记开发的方法、特点及应用现状，并介绍了利用分子生物技术开发SSR、SRAP、TRAP标记的手段及从RAPD、AFLP等标记向单位点特异性PCR标记(如SCAR、CAPS、dCAPS等)转化的进展。最后，对不同植物标记开发策略的选择及以上各种技术在功能标记开发中的应用前景作了展望。关键词标记开发,生物信息学,生物技术,功能标记TheProgressofDevelopmentforPlantMolecularMarkersBasedonBioin-formaticsandBiotechnologyZhang
3、Zhengfeng1XiaoBenze2*1HubeiKeyLaboratoryofGeneticRegulationandIntegrativeBiology,CentralChinaNormalUniversity,Wuhan,430079;2CollegeofPlantScienceandTechnology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan,430070*Correspondingauthor,benzexiao@mail.hzau.edu.cnAbstractThegenomesequencingandexpressedse
4、quencedtag(EST)projectsgeneratedavastamountofse-quencesdata.Simultaneously,theincreasingbioinformaticssoftwarefacilitatesthedevelopmentofmolecularmark-ers.Additionally,todevelopmolecularmarkersinlaboratorywillbenefitfromtheadvancedbiotechnologyandcon-structionofbatchofoperationsystems.Them
5、ethods,characteristicsandcorrespondingapplicationofdevelopingSNPandSSRbasedonbioinformaticsanddevelopingSSR,STAP,TRAPonbiotechnologywerereviewed.TheprogressofconversionofRAPDandAFLPtosingle-locusspecificPCRmarkerswerealsopresented.Finally,howtoselectsuitabletechniquefordifferentplantsandde
6、velopfunctionalmarkersareelucidated.KeywordsMarker-developing,Bioinformatics,Biotechnology,Functionalmarker分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之近20年来分子标记对植物遗传和育种研究的后发展起来的一种新的遗传标记形式。自从1980年发展起到了革命性的作用，其应用涉及到重要性状Botstein等首次提出用RFLP作为遗传标记构建遗传基因或QTL的定位、遗传图谱的构建、种质资源遗连锁图谱以来，分子标记技术及其应用研究日新月传关系的确定、杂种优势群的划分、比较图谱分析、
7、异，相继出现了二十多种DNA分子标记方法，构成分子标记辅助选择及图位克隆等多个领域。本文重点介绍利用生物信息学及分子生物学手段开发分子了分别以RFLP、SSR及SNP为代表的三代分子标标记的研究进展。记。按其技术原理，可分为三大类：第一类是以分子杂交为基础的标记技术，主要是RFLP。第二类是以1利用数据库序列信息和生物信息学手段开PCR反应为基础的一系列分子标记技术，如RAPD、发新的分子标记SCAR、STS和SSR等。第三类是以酶切和PCR为基础的分子标记技术，主要有AFLP和CAPS等(表1)。随着表达序列标签
