植物分子标记研究进展

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1、植物分子标记研究进展摘要主要介绍了以RFLP、SSR及SNP为代表的3代植物分子标记的基木原理、特征及应用范围，并针对不同植物分子标记的发展前景进行了阐述。关键词植物分子标记；原理；应用；进展屮图分类号Q7文献标识码A文章编号1007-5739(2015)15-0047-02ResearchProgressofPlantMolecularMarkersHANLeiSUNXin(DepartmentofLifeScienceofHengshuiUniversity,HengshuiHebei053000)A

2、bstractBasicprinciple,characteristicandapplicationscopeofplantmolecularmarkerswiththerepresentativeofRFLP,SSRandSNPwereintroduced,thedevelopmentprospectsofvariousplantmolecularmarkersweredescribed.Keywordsplantmolecularmarkers；principle；application；progre

3、ss分子标记(MolecularMarkers),是以个体间遗传物质内核昔酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映。它是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的遗传标记方法。随着分子生物学的发展，DNA分子标记技术已有数十种，分子标记的方法越来越表现出其优越性。冃前，在物种亲缘关系鉴别、基因组作图、植物遗传育种等方面分子标记已得到了广泛应用。1第1代分子标记1.1限制性内切酶片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP

4、)RFLP是以DNA-DNA杂交为基础的第1代分子标记，由于不同个体等位基因之间碱基的替换、插入、缺失或重复等变化，造成了限制性内切酶的识别和酶切发生改变，从而造成基因型之间酶切片段长度的差异，可反映DNA分子上不同酶切位点的分布情况。RFLP在基因组中以低拷贝编码序列为主，存在稳定，具有共显性的特点。但其操作工序比较复杂，对DNA的需求量也比较大，不仅成本高，而且检测的周期较长，在大规模的分子育种屮不适用。余四斌等利用RFLP对生产上广泛应用的优良杂交组合汕优63的分离群体进行分析，很好地定位了32个控

5、制产量及其构成性状的QTLstllo孙传青等利用RFLP分子标记研究了中国、南亚、东南亚普通野生稻与栽培稻和粕粳之间的遗传分化关系，研究表明粕粳演化是多途径的，粕粳分化是栽培稻核DNA遗传分化的主流［2］。1.2随机扩增多态性DNA标记(RandomAmplifiedPoly-morphicDNA,RAPD)RAPD技术是建立在PCR基础之上的。它应用了PCR的反应原理，以基因组DNA为模板，在热稳定的DNA聚合酶作用下，以单个随机核背酸序列(通常为10个碱基对)为引物，进行PCR扩增。扩增产物经过电泳的

6、分离、染色后，采用紫外透视仪进行检测。扩增产物的多态性反映了基因组的多态性。与RFLP相比，RAPD需要的模板量较少、灵敏度高、操作简便、快捷的特点，在基因定位、克隆及辅助选择育种中可以广泛应用。但易受试验条件影响，重复性差，产率低［3］。胡保忠等利用RAPD分子标记用43个随机引物对11个紫花苜蓿进行扩增，共检出440条扩增片段，对紫花苜蓿进行了很好的聚类分析［4］。1.3扩增片段长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPo1-ymorphism,AFLP)AFLP是基于PCR的一种选

7、择性扩增特异片段的方法。对不同物种的基因组DNA进行利用，经过限制性内切酶的酶切后，可以得到大小不同的分子片段，将酶切片段与相应的接头连接，以接头序列及邻近内切酶的识别位点作为引物的结合点，采用含冇1〜3个选择性碱基的不同引物进行DNA扩增，不同选择性碱基的数日、种类和顺序决定了扩增片段的特异性。扩增产物经放射性同位素标记、电泳分离，最终根据凝胶上DNA条带的有无來检验其多态性。它兼具了RFLP的可靠性和RAPD的方便性等优点，但它対DNA的纯度要求较高，操作繁琐。黄想安等利用AFLP技术表明石蒜属具冇卄

8、•常高的种间遗传多样性，为石蒜物种的分类鉴定提供一个很有效的依据［5］o2笫2代分子标记主要包括简单序列重复(SimpleSequenceRepeat,SSR)。SSR也称微卫星DNA,不同的重复碱基对串联数Fl决定了其高度多态性。它根据微卫星两端互补序列进行引物的设计，然后通过PCR进行扩增，由于不同的核心序列串联重复数目，扩增出的PCR产物的长度也有所不同，通过电泳技术对扩增的产物进行分离，结合片段的大小决左基因型，并对等