gaussian基本概念和用法

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1、1计算流程上面的图应该是从L301说起的,即图中的“基组”,L301的作用是产生基组信息。(在这之前还有L1:处理计算执行路径,创建执行链接的列表,并初始化scratch文件;L101:读取标题和分子说明部分;L103:berny优化到最小值;L202:重新定位坐标,计算对称性,检查变量)“基组”之后是“分子结构”即L401,形成初始的分子轨道初猜。第一个框中有“分子轨道”和“能量”两项,我想这应该指的是L502即迭代求解SCF方程。下面红线圈的框中则是迭代求解的具体过程。每次迭代完毕都得到一个能量。即(SCFD

2、one: E(RHF)= -xx.xxxx  A.U.after xxcycles)然后是L103判断力和位移是否满足收敛条件。如果满足(即四个yes),则进行布居分析等,并完成计算。如果不满足,则继续调整分子结构(L401),再次进行迭代求解,反复这个过程,直到满足力和位移收敛条件为止。如果不是HF方法而是多体微扰,CI等后-scf方法的话,在每次迭代(L502)完成后还要多一步相关能的计算,以MP2为例,迭代完成后多出:L801(双电子积分变换的初始化),L906(半直接的MP2)和L1002(迭代求解CPH

3、F方程)等计算。对于楼主的图,我觉得力和位移判断为NO以后,箭头应该指向最头上的“基组”,因为实际过程中,每次构型调整都会重新定位坐标和产生基组信息。常见问题分析1.检查是否有初始文件错误在命令行中加入%kJobL301or%kJobL302如果通过则一般初始文件ok。常见初级错误:a.自旋多重度错误;b.变量赋值为整数;c.变量没有赋值或多重赋值;d.键角小于等于0度,大于等于180度e.分子描述后面没有空行;f.二面角判断错误,造成两个原子距离过近;g.分子描述一行内两次参考同一原子,或参考原子共线2.SCF

4、(自洽场)不收敛则一般是L502错误,省却情况做64个cycle迭代(G03缺省128cycles)a.修改坐标,使之合理;b.改变初始猜 Guess=Huckel或其他的,看Guess关键词;c.增加叠代次数SCFCYC=N1计算流程上面的图应该是从L301说起的,即图中的“基组”,L301的作用是产生基组信息。(在这之前还有L1:处理计算执行路径,创建执行链接的列表,并初始化scratch文件;L101:读取标题和分子说明部分;L103:berny优化到最小值;L202:重新定位坐标,计算对称性,检查变量)“

5、基组”之后是“分子结构”即L401,形成初始的分子轨道初猜。第一个框中有“分子轨道”和“能量”两项,我想这应该指的是L502即迭代求解SCF方程。下面红线圈的框中则是迭代求解的具体过程。每次迭代完毕都得到一个能量。即(SCFDone: E(RHF)= -xx.xxxx  A.U.after xxcycles)然后是L103判断力和位移是否满足收敛条件。如果满足(即四个yes),则进行布居分析等,并完成计算。如果不满足,则继续调整分子结构(L401),再次进行迭代求解,反复这个过程,直到满足力和位移收敛条件为止。如

6、果不是HF方法而是多体微扰,CI等后-scf方法的话,在每次迭代(L502)完成后还要多一步相关能的计算,以MP2为例,迭代完成后多出:L801(双电子积分变换的初始化),L906(半直接的MP2)和L1002(迭代求解CPHF方程)等计算。对于楼主的图,我觉得力和位移判断为NO以后,箭头应该指向最头上的“基组”,因为实际过程中,每次构型调整都会重新定位坐标和产生基组信息。常见问题分析1.检查是否有初始文件错误在命令行中加入%kJobL301or%kJobL302如果通过则一般初始文件ok。常见初级错误:a.自旋

7、多重度错误;b.变量赋值为整数;c.变量没有赋值或多重赋值;d.键角小于等于0度,大于等于180度e.分子描述后面没有空行;f.二面角判断错误,造成两个原子距离过近;g.分子描述一行内两次参考同一原子,或参考原子共线2.SCF(自洽场)不收敛则一般是L502错误,省却情况做64个cycle迭代(G03缺省128cycles)a.修改坐标,使之合理;b.改变初始猜 Guess=Huckel或其他的,看Guess关键词;c.增加叠代次数SCFCYC=N(对小分子作计算时最好不要增加,很可能结构不合理);d.iop(5

8、/13=1)这样忽略不收敛,继续往下做。3.分子对称性改变a.修改坐标,强制高对称性或放松对称性;b.给出精确的、对称性确定的角度和二面角。如CH4的角度给到109.47122;c.放松对称性判据 Symm=loose; d.不做对称性检查iop(2/16=1),最好加这个选项),iop(2/16=2)则保持新的对称性来计算4.Opt时收敛的问题a.修改坐标,使之合理;b

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