北京油鸡不同组织和不同体重个体基因组dna甲基化分析

《北京油鸡不同组织和不同体重个体基因组dna甲基化分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、,Jr万方数据硕士学位论文赡乞和一北京油鸡不同组织和不同体重个体基因组DNA甲基化分析DNAmethylationanalysisfordifferenttissuesandindividualsinweightinBeijingYouchicken作者：李金龙导师：徐青北京交通大学2014年6月万方数据学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解北京交通大学有关保留、使用学位论文的规定。特授权北京交通大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，提供阅览服务，并采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编以供查阅和借阅。同意学校向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘

2、。学校可以为存在馆际合作关系的兄弟高校用户提供文献传递服务和交换服务。(保密的学位论文在解密后适用本授权说明)学位论文作者签名秘签字日期：沙‘垆年∥月，舀日导师签名：僭酋签字日期：勿f忤67月“日万方数据学校代码：10004北京交通大学硕士学位论文北京油鸡不同组织和不同体重个体基因组DNA甲基化分析密级：公开DNAmethylationanalysisfordifferenttissuesandindividualsinweightinBeijingYouchicken作者姓名：李金龙导师姓名：徐青学位类别：理学学号：11121800职称：副教授学位级别：硕士学科专业：生物化学与

3、分子生物学研究方向：分子遗传学北京交通大学2014年6月万方数据致谢首先感谢我的导师徐青副教授三年来对我的辛勤培养和谆谆教诲，从论文的选题、构思，实验方案的设计、制定，实验的实施到论文的撰写，都倾注着徐青老师的智慧和汗水。感谢徐老师在生活以及为人处世方面上给予的亲切指导和无微不至的关心，徐老师严谨的治学态度、谦虚的师者风范为我在将来的学习和工作中树立了良好的榜样。值此向徐老师表示衷心的感谢，祝愿老师工作顺利，身体健康!感谢生命科学与生物工程研究院黄家强教授、何金生教授、王字玲教授、朱运峰教授、晏琼副教授、江红副教授、胡红刚副教授、侯玲玲副教授、张莹副教授、张丽姝副教授、付远辉副教

4、授、纪丰民副教授等人在学习、实验以及论文撰写方面给予的指导和帮助。感谢军事医学科学院余云舟副研究员、中国农业大学王雅春副教授在实验指导和数据分析方面提出的宝贵建议。感谢本课题组赵萌师姐、刘莉莉师姐、刘蕤，马尧师弟、王海潮师弟、李玮师妹、周晓萌师妹、林舒晔师妹等以及王楠在实验和生活中给予的关心和帮助，感谢生研院其他老师和同学的帮助。感谢北京市自然科学基金项目(6112018)、中央高校基本科研业务费专项基金项目(2012JBE003)和国家自然科学基金青年基金项目(31101711)对本研究的资助。感谢学校和学院对我多年来的培养，使我不断提升自己。感谢我的家人，他们的理解和支持使我

5、能够在学校专心完成我的学业。最后，再次向所有关心、帮助我的老师、同学、亲人和朋友致以诚挚的感谢!万方数据摘要摘要：在真核生物中，DNA甲基化是表观遗传学重要的修饰方式之一，对基因的表达具有调控作用，研究表明：DNA甲基化在动物生长和组织发育分化中具有重要作用。本研究以17周龄北京油鸡肌肉和卵巢组织为实验材料，应用甲基化敏感扩增片段多态性(Methylationsensitiveamplifiedpolymorphism，MSAP)方法检测2个组织基因组DNA甲基化程度，通过毛细管电泳结果优化了实验条件，开发了MSAP荧光检测数据的自动分析软件，对北京油鸡肌肉和卵巢组织及不同体重组

6、间基因组DNA甲基化水平差异进行研究。结果如下：l、采用毛细管电泳荧光检测技术分析MSAP选择性扩增产物，通过对基因组DNA用量、预扩增产物稀释倍数、选择性引物浓度、M矿浓度、dNTPs浓度、电泳DNA量、内标量和进样时问等8个主要参数进行分析和优化，优化了用于北京油鸡基因组DNA甲基化分析的MSAP毛细管电泳荧光检测体系。2、应用MSAP方法检测北京油鸡肌肉组织基因组DNA甲基化水平。对获得的MSAP荧光检测初始数据分别应用直接取整法、整区问放置法和半区间放置法等三种自动处理方法进行分析并比较。结果显示：整区间放置法和半区问放置法比直接取整法更适用于MSAP荧光检测初始数据的分

7、析，建立了基于半区间放置法分析原理的可在线分析MSAP荧光检测初始数据的软件--MSAPAnalyst。3、应用MSAP方法检测北京油鸡肌肉和卵巢组织的基因组DNA甲基化状态。12对选择性扩增引物共产生53027条清晰的扩增条带，平均每个个体每对引物组合可获得150个条带。在检测的个体中，肌肉组织的甲基化水平为54．04％，卵巢组织为57．06％，2种组织的甲基化水平差异显著(p<0．05)，肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化差异主要存在于全甲基化位点中。分离鉴定了5个可能与组织分