云南省静脉注射吸毒人群中hcv感染的分子流行病学研究

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1、硕士学位论文学校代码：10023学号：$2011018015云南省静脉注射吸毒人群中HCV感染的分子流行病学研究AMolecularEpidemiologicalResearchonHepatitisCVirusInfectionamongIntravenousDrugUsersinYUnnan量，r0VinceIr1h●所院：北京协和医学院医学生物学研究所姓名：张智辉指导教师：董少忠研究员导师小组：寸群副研究员学科专业：生物化学与分子生物学研究方向：分子流行病学完成日期：2014年5月中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生论文执⋯：：

2、：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：兰：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：：．＼愀螋必I：：：1Abstract／．。o-r2摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。lm帆m蚍幽燮I婴必l!j：I⋯。⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．YZD‘了一⋯1．弓l言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．：：：：：．．：：：⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．42．研究目的及意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯113．材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．124．实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。155．实验结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。21中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生论文5．8云南省静脉吸毒人群中HCV的基因型分布状况与其他地区分布状况的对比⋯⋯⋯⋯285．9云南省静脉吸毒人群中现有HCV的基因型分布状况与早期研究的对比⋯⋯⋯⋯⋯⋯296．讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．3

4、37．d、结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。39参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。41附录一HCV阳性样品测序序列⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯45附录二主要缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．78附录三主要溶液配制方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯79致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．80研究生简历⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯8l独创性声明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯82中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生论文摘要丙型肝炎(HepatitisC)是威胁人类身体健康的重要传染病，其病原体是丙型肝炎病毒(HepatitisCvirus，HCV)，全球范围内大约有1．7亿人感染了HCV，我国的感染率约为3．2％。HCV感染容易慢性化，慢性丙型肝炎约有20％．30％会在20年内缓慢进展为肝硬化和肝癌，HCV感染成为导致肝癌及终末期肝病的重要原因。HCV的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)缺乏校对功能，使得RNA在复制过程中错配

6、率极高，最终导致了HCV基因组中核苷酸突变频率极高，为基因分型提供了基础。HCV可分为6个主要基因型，每个基因型又可分为若干亚型，HCV基因型的不同直接影响HCV的致病力和患者对药物治疗的反应性。在静脉注射吸毒人群中HCV的感染比例极高(1S．6％-98．7％)，云南省地处中国西南边陲，与缅甸、老挝、越南三国接壤，紧邻世界最大的鸦片种植地“金三角”，是毒品运输入中国内地的重要节点，具有大量的吸毒人员。相关调查显示云南省静脉注射吸毒人群HCV的感染率接近80％。本研究从昆明市疾病预防控制中心获得了100份2012年1月至5月期间收集于云南

7、不同地区吸毒人员的HCV阳性血清样本，通过RT-PCR扩增得到HCVC／E1区段，经过T-A克隆和测序，确定了云南省共分布8个亚型的HCV(1a、lb、3a、3b、6a、6n、6u、6v)。主要流行的基因型为6型(47％)，其次为3型(41％)及1型(12％)。在亚型分布中，6n亚型(30％)及3b亚型(29％)为主要流行的亚型，占到样品总数的59％。本研究通过对比云南省与其他地区静脉注射吸毒人群HCV基因型分布情况后发现，云南省HCV基因型分布情况与中国南部的情况相似，而与中国东部地区有明显区别。通过对比本次研究的结果与早前云南省相关

8、研究的结果，发现在五年时间内云南省静脉注射吸毒人群中6型HCV比例由25％上升为47％，其中6a亚型由5％上升为15％，6n亚型由11．2％上升为30％，而3a亚型及1b亚型的频率下降接近50％。本研究的结