中国人遗传性非息肉性结直肠癌(hnpcc)大片段异常检测与基因数据分析

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1、万方数据目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．1Abstract．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．，．．⋯．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．，．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3第一部分HNPCC病人MMR基因大片段异常的检测⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一91．1．1HNPCC的临床特征⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．91．1．2HNPCC临床诊断标准⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯101．113HNPCC致病机制及大片段缺失相关基因简述⋯⋯⋯⋯⋯121

2、．1．4HNPCC大片段缺失的研究现状及方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯141．2材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．171．2．1病例收集⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯171．2．2主要试剂及仪器⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯171．2．3血清DNA的提取与处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．2l1．2．4MLPA操作流程⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．231．3结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．241．3．1单个样本的结果分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．241．3．2所有样本结果统计⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯．．271．4讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．291．4．1实验与数据分析方法讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．291．4．2样本结果的讨论分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．301．5总结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．31万方数据第二部分MSH6、PMS2及MLH3基因已发表数据的统计分析⋯⋯⋯⋯322。1引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。322．1．1数据挖掘与生物信息学介绍⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．322．1．2生物信息学手段在HNPCC中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．332．1．3MSH6、

4、PMS2和MLH3基因简介及相关研究⋯⋯⋯⋯⋯342．2材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．372．2．1数据收集⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯372．2．2突变类型的确定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．382．2．3患者人种的确定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一382．2．4统计分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一382．3结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．392．3．1不同突变类型的突变分布⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一402．3．2MSH6，PMS2和MLH3基因的突变热点⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．432．3．3对MSH6基因的进一步分析⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．452．4讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯482．5总结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一52后记⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．57附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．58附录一文章发表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一58附录二补充数据⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．59II呲5帅7，⋯⋯⋯川—Jm5眦6吣8㈣2一眦Y万方数据中文摘要遗传性非息肉性结

6、直肠癌(HNPCC)是一种常染色体显性遗传病，是遗传性结直肠癌中最常见的一种疾病，在所有的结直肠癌中约占2．5％。HNPCC与散发性结直肠癌(sporadiccolorectalcancer，SCRC)及家族性腺瘤性息肉病(FamiliarAdenomatousPolyposis，FAP)相比，无论在发病机制、临床特征、治疗方案的选择和随访方案的制定上均不尽相同。为此，区分HNPCC与其他类型的结直肠癌具有重要的临床意义。目前，世界许多国家和地区都制定了一定的HNPCC临床诊断标准，但要确诊HNPCC家系和HNPCC患者，还需要依赖于错配修复(MismatchRepair，MMR)基因

7、胚系病理性突变的检出。主要致病的MMR基因包括MLHl、MSH2、MSH6、PMSl、PMS2及MLH3这六种，而其中主要致病突变发生在MLHl和MSH2基因中，在HNPCC相关基因突变中约占90％。但是目前对于MMR基因的筛查大多是针对点突变，而这些检测方法是无法检测出于基因中火片段的缺失或复制的，因此大片段异常在HNPCC家系检测中常常被漏诊。而事实上，有研究报道大片段缺失在IVIMR基因中并不是小概率事件，在MSH2和MLHl基因中，大片