plce1基因多态性及中国中部人群食管鳞癌遗传易感性

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1、原创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体,均己在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。学位论文作者:日期:年月日学位论文使用授权声明本人在导师指导下完成的论文及相关的职务作品,知识产权归属郑州大学。根据郑州大学有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅;本人授权郑州大学可以将本学位论文的全部或部分编入有关数据库进行检索,可以采用影印

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3、生(singlenucleotidepolymorphism,SNP)位点rs2274223,在三个基于中国人群有关食管鳞癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)的大规模全基因组关联分析(Genome.wideassociationstudy,GWAS)研究中均被发现,其位于磷脂酶Col(phospholip

4、aseCepsilon1,PLCEl)基因。PLCEl基因编码的PLCEl(phospholipaseCepsilon1)蛋白是磷脂酶C(phospholipaseC,PLC)家族一个独特的成员,其可以催化多磷酸肌醇水解,产生1,4,5-三磷酸(Inositol,1,4,5-triphosphate,IP3)和二酰甘油(diacylglcerol,DAG)两种第二信使,继而参与细胞的生长和分化。因此,深入探讨PLCEl基因多态性与食管鳞癌的关系尤为必要。这将为探讨食管鳞癌的病因学提供科学依据,同时,这将对筛选高危人群和保护易感人群有重要意义,也为采取有效的干预措施提供理论基础。

5、目的探讨PLCEl基因三个功能性位点的多态性与食管鳞癌的关系以及基因.基因,基因.环境的交互作用,为揭示食管癌病因学机制提供理论依据。方法在中国中部汉族人群中,采取病例.对照研究方法,按照频数匹配原则,选取381例医院来源的食管鳞癌新发病例和420例健康对照,采用聚合酶链反应.限制性片段长度多态·I生(PCR.RFLP)技术对rsl7417407位点和rs2274223位点进行基因型检测;采用等位基因特异聚合酶链反应(Allele.specificPCR,AS.PCR)技术对rs2274224位点进行基因型检测。利用统计学软件SPSSl7.0,对病例组和对照组的样本特征进行频率

6、描述,利用,检验比较食管鳞癌患者和健康对照组之间的年龄、性别、吸烟、饮酒及肿瘤家族史的差异,采用Hardy.weinberg在线分析软件分析Hardy-Weinberg平衡。采用非条件二分类Logistic回归比较各基因型在病例组和健康对照组之间分布频率的差异。利用Haploview4.0软件计算连锁不平衡值(LD)值。利用SHEsis在线软件进行单体型预测、构建及分析。利用趋势矿检验,分析突变位点数量摘要与食管鳞癌发病风险之间的剂量反应关系。利用多因素降维法(MDR)分析基因.环境交互作用。结果单个SNP位点分析表明,rs2274223位点突变杂合基因型AG、突变纯合基因型G

7、G及联合突变基因型(AG+GG)均能增加食管鳞癌的发病风险,其0R(95%CI)分别为1.80(1.30,2.49)、2.80(1.45,5.39)、1.92(1.41,2.62)。rs2274224位点突变杂合基因型CG能降低食管鳞癌的发病风险(锹:O.65,95%CI:O.46.0.91)。单体型GrSl74l7407A体2274223C巧2274224可降低食管鳞癌的发病风险(C恹:O.76,95%CI:O.62.0.93),同时,单体型GrSl7417407Grs2274223CrS2274224、Trsl7417407Grs2274223C体2274224均可增加食管

8、鳞癌的发病风险,其0R(95%C1)分别为1.75(I.33,2.18)、2.51(1.15,5.49)。基因.环境交互作用分析显示,最优模型为rs2274223、rs2274224、肿瘤家族史及吸烟四因素的交互。该模型交叉验证的统计量及其对应值分别为训练集平均精度:0.66、测试集平均精度:0.58、十重交叉验证的一致率(比值)为7:10。结果表明,在该模型中“高危”人群食管鳞癌的发病风险是“低危”人群的3.67倍(锨:3.67,95%CI:2.74.4.92)。结论PLCEl基因rs22

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