欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:33262656
大小:10.21 MB
页数:64页
时间:2019-02-23
《广西烟草病毒病病原的分子鉴定》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、广西大学硕士学位论文广西烟草病毒病病原的分子鉴定姓名:赵家新申请学位级别:硕士专业:植物病理学指导教师:蔡健和;蒙姣荣20120628广西烟草病毒病病原的分子鉴定摘要病毒病是烟草生产上的重要病害,为制定有效防治措施提供理论依据,我们对广西烟草病毒病的发生情况进行了调查鉴定。根据症状类型把病害分为花叶类病毒病、坏死类病毒病、曲叶类病毒病。通过ELISA、PCR、RT-PCR、小RNA测序等方法对采集的样品进行了鉴定,共鉴定出6种病毒,包括烟草花叶病毒(TMv)、黄瓜花叶病毒(CⅢ)、烟草脉带花叶病毒(TVBMV)、马
2、铃薯Y病毒(PVY)、烟草环纹斑点病毒(TZSV)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV);TVBMV是首次在广西烟草上检测到,在花叶类病毒病样品中检出TMV、CMV、TVBMV,检出率最高的是TMV,检出率为58.7%,CMV次之,检出率9.8%,1个样品为TMV和CMV混合侵染,1个样品为TMV和TVBMV混合侵染。在坏死类病毒病中,PVY的检出率为4.3%,1个样品中检测到TZSV,从田林县八渡乡的烟草曲叶病样品中检测到TYLCV。对TMV、CMV、PVY三种病毒CP基因序列分析发现,7个TMV分离物CP基因之间存在
3、27个碱基的差异,用软件翻译成氨基酸序列显示,仅BS.3、HZ.1与其他序列相比各存在1个氨基酸残基的差异,HZ.2与其它序列相比存在2个氨基酸残基的差异,将TMVCP序列与NCBI数据库序列比对发现BS一1、HZ.3与Yunan分离物相似性最高在99.6%以上,BS.2、BS.3、HZ.1与Fujian分离物相似度高于98.1%,HC.1、HC.2与Shanxi分离物相似大于99.6%。将CMV的HZ分离物与已知株系的序列构建系统进化树,可以推断其属于CMV亚组I。通过将PVY的I-IZ分离物CP基因与已知株系的
4、PVYCP基因做相似性比对和构建系统进化树,分析可得,PVY的HZ分离物CP基因可能属于0株系组。关键词:烟草病毒病的鉴定;番茄环纹斑点病毒;烟草花叶病毒;黄瓜花叶病毒;烟草脉带花叶病毒MolecularIdentificationofTobaccoVirusDiseasesAbstractlid。‘。‘ProvinceInGuangxirovnceVirusdiseasesareimportantdiseasesintobaccoproduction.Inordertodevelopeffectivepreven
5、tionandcontrolmeasuresfortobaccovirusdiseases,weconductedasurveyoftheoccurrenceoftobaccovirusdiseasesinGuangxiZhuangAutonomousRegion.Basedonsymptoms,thevirusdiseasesoftobaccoweredividedintomosaicvirusdisease,necrosis—likevirusdisease,tobaccoleafcurldisease.111
6、ecollectedsampleswereidentifiedbyELISA,PCR,RT-PCRandsmallRNAsequencingandsixkindsofviruswereidentifiedincludingTobaccomosaicvirus(TMV),Cucumbermosaicvirus(CMV),TVBMV,PotatovirusY(PVⅥ,Tomatozonatespotvirus(TZSV)andTobacco钯afcurlvirus(TLCV).Tobaccoveinbandingmos
7、aicvirus(TVBMV)wasidentifiedfirstinGuangxitobacco.TMV,CMV,TVBMVweredetectedinmosaicviresdiseaseandTWVgotthehighestrelevanceratiowhichwas58.7%.Thefollowingrelevanceratiois9.8%fromCMV.OnesampleWasmixedlyinfectedbyTMVandCMV.Meanwhileanothersamplewasmixedlyinfecte
8、dbyTMVandTvBMVInnecrosis-likevirusdisease,therelevanceratioofPVYwas4.3%.TZSVwasdetectedonlyinonesamplefromJingxiCountyandTYLCVwasdetectedfromsamplesoftobaccoleafcurldiseaseswhichwe
此文档下载收益归作者所有