青枯雷尔氏菌dna多态性的its和rapd分析

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1、14基于ITS序列和RAMS标记分析青枯雷尔氏菌的遗传多样性*郑雪芳，车建美，林营志，蓝江林，刘波**基金项目：国家863计划项目（2006AA10A211）农作物重大病害多功能广谱生防菌剂研究和创制；福建省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金（STIF-Y03）；福建省青年科技人才创新项目（2003.J046）。作者简介：郑雪芳，女，1977年生，硕士。E-mail：zhengxuefang2003@yahoo.com.cn**通迅作者。Authorforcorrespondence。博士，：刘波博士、研究员，从事微生物生物技术和生物农药研究。，Tel:1390591

2、7339;E-mail:liubo@faas.cn,fzliubo@163.com（福建省农科院生物技术研究所，福州350003）摘要：应用ITS序列和RAMS（Randomamplifiedmicrosatellites）技术对福建省不同地域和，不同寄主作物的青枯雷尔氏菌进行遗传多样性研究。结果表明，供试的21株青枯雷尔氏菌的ITS区序列有3种类型，这3种类型菌株的ITS序列只有1～-2个碱基的差异，与参比菌株GMI1000的ITS区序列或者相同或者有1～-2个碱基的差异。在此基础上，利用RAMS技术进一步分析表明，供试的青枯雷尔氏菌及参比菌株GMI1000的基因组DNA间存在

3、丰富的多态性。聚类结果显示，供试菌株可聚为3个类群，同一寄主作物的菌株聚在同一类群中，同一地理来源的菌株聚在同一亚类群中，说明青枯雷尔氏菌的遗传分化与寄主作物和地理来源都存在相关性，与寄主作物的关系更密切。关键词：青枯雷尔氏菌；遗传多样性；ITS序列分析；RAMS标记GeneticDiversityAnalysisofRalstoniaSolanacearumsolanacearumBasedonRAMSMarkerandITSSequenceZHENXue-Fang,CHEJian-Mei,LINYing-Zhi,LanJiang-lin,LIUBo(Biotechnology

4、Institute，FujianAcademyofAgriculturalSciences，Fuzhou350003，China)Abstract:Geneticdiversityamong21strainsofRalstoniasolanacearumfromdifferentclimatezonesanddifferenthostcropwasanalyzedbyITSsequenceandRAMSmethodsrespectively.ThreetypesofITSsequencewereobtained.Amongthem,therewasonlyoneortwobase

5、diversity,andITSsequenceoftestedstrainswasthesametoGMI1000oroneortwobasedifferencetoGMI1000.ThetotalgenomicDNAwasthenexaminedbysensitiveRandomamplifiedmicrosatellitesRAMS（RAMSRandomamplifiedmicrosatellites）RAMStechnique.TheresultsrevealedanobviousdiversityoftheirgenomicDNA.Clusteranalysisbase

6、dontheRAMSbandsshowedthattestedisolatescouldbeseparatedinto3clusters.Thestrainscomefromthesamehostcropwereclusteredintoonegroup,andthestrainscomefromthesameclimatezoneswerebelongedtothesamesubgroup.ItisconcludedResultofthisstudysuggestedthatgeneticdiversityvariationofR.solanacearumwasrelatedt

7、ocomesfromdifferenthostcropanddifferentclimatezones,mostlycomesfromdifferencloselyrelatedtothostcrop.Keywords：Ralstoniasolanacearum；Geneticdiversity；ITSsequence；RAMSmarker细菌性青枯病是由青枯雷尔氏菌（Ralstoniasolanacearum）引起的毁灭性植物病害，广泛分布于热带、亚热带及温带地区，在我国南方各