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《基于box-pcr 和rep-pcr 技术的青枯雷尔氏菌多态性分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、20基于BOX-PCR和REP-PCR技术的青枯雷尔氏菌多态性分析基金项目:国家自然基金(No.30871667),福建省自然基金项目(No.2008J0054),福建省自然基金项目(No.2009J01087)和福建省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金(No.STIF-Y03)作者简介:林海云(1988-),硕士研究生,Tel:18705044875;E-mail:linhaiyun880518@163.com。通讯作者:刘波(1957-),博士,研究员,研究方向为微生物生物技术与农业生物药物,Tel:13905917339;E-mail:liubofaas@163.com
2、。林海云1,2,车建美1,刘波1*,郑雪芳1,肖荣凤1(1、福建省农业科学院农业生物资源研究所,福州350003;2、福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室,福州350002)摘要:研究青枯雷尔氏菌的遗传多样性对于了解青枯病的发生和流行具有十分重要的意义。本文利用青枯雷尔氏菌特异性引物鉴定84株来自福建地区不同寄主的青枯雷尔氏菌,结果表明,这些菌株均在504bp位置出现特异性条带;采用BOX-PCR和REP-PCR对这些菌株进行多态性分析表明BOX-PCR扩增出19条特异性条带,REP-PCR扩增出20条特异性条带。系统聚类结果表明,青枯雷尔氏菌的遗传分化与寄主作物和地理来源都
3、存在相关性,其中,寄主植物是在遗传差异中起主导作用。进一步分析可知,地域性的差异主要由BOX-PCR提供,寄主间的差异主要由REP-PCR提供。BOX-PCR和REP-PCR多态性分析技术为我国青枯雷尔氏菌多态性研究提供了另一条途径。关键词:青枯雷尔氏菌;多态性;BOX-PCR;REP-PCR;菌株鉴定GeneticdiversityanalysisofRalstoniasolanacearumbasedonBOX-PCRandREP-PCRLinHaiYun1,2,CheJianMei1,LiuBo1*,ZhengXueFang1,XiaoRongFeng1(1.Agricultura
4、lBio-ResourcesResearchInstitute,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou,350003,China;2.KeyLaboratoryofBiopesticideandChemicalBiology,MinistryofEducation,FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou,350002,China)Abstract:ThegeneticdiversityofRalstoniasolanacearumwasveryimportantforknowingthepo
5、lymorphismofbacterialwiltdiseases.ThespecialprimerwasusedtoidentifyRalstoniasolanacearumstrains,inwhich84strainsofR.solanacearumfromdifferenthostplantsintheFujianprovincewereidentifiedwithaspecificbandinthelocationof504bp.ByBOX-PCRandREP-PCRpolymorphismanalysis,theBOX-PCRamplified19specificbandsa
6、ndtheREP-PCRamplified20specificbands.TheclusteranalysisshowedthatthegeneticdiversityofR.solanacearumwasconcernedwithgeographicoriginandhostplants,respectively.ThedifferenthostplantsplayedaleadingroleinthegeneticdifferenceofR.solanacearum,whilethedifferenceofregionswasmainlyprovidedbytheBOX-PCR,an
7、dthedifferenceofhostplantswasmainlyprovidedbyREP-PCR.ItwasindicatedthatREP-PCRandBOX-PCRcouldprovideanalternativewayforthestudyofgeneticdiversityofR.solanacearum.Keywords:Ralstoniasolanacearum;Geneticdiversity;BOX-PCR;