贝类遗传评估体系的建立研究

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1、谨以此论文献给我敬爱的父母及导师io,,,。二?,,。,.。^,~¨M、I贝类遗传评估体系的建立研究学位论文完成日期:指导教师签字:答辩委员会成员签字:fIIllllllffllrfllrllrrlfrlllrlllfrrllllflllrfllllllY1828282互珏独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含未获得!连;垫遗直墓丝重噩犍型岂麴的:奎拦亘窒≥或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了

2、明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名:疹勉签字日期:≥少年∥月乒日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,并同意以下事项:l、学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。2、学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学“中国学术期刊(光盘版)电子杂志社”用于出版和编入嗍《中国知识资源总库》,授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名:导师签字:签字日期:

3、纠矿年舌月乒日.签字日期:知辟么月4日贝类遗传评估体系的建立研究摘要贝类遗传育种技术在过去的30年中发展迅速,选择育种、杂交育种、染色体组操作技术和分子标记技术得到了广泛应用,但基于BLUP遗传评估的多性状选择育种研究仍处于起步阶段。针对这一现状,本研究构建了国际上首个贝类遗传育种评估体系,其中包括贝类表型性状测量的标准化体系,用于基础数据的收集;表型性状值和个体遗传信息记录的数据库体系,用于数据的管理和查询提取;以及贝类遗传评估体系,用于遗传参数和育种值的计算。’贝类表型性状自动测量系统由体尺性状测量模块与体重性状测量模块两部、分组成。体尺性状测量模块用图像识别技术测量贝类的壳尺寸;体重性状

4、测量模块通过计算机串口与电子天平相连接记录贝类的体重。系统将数据测量、记录及录入计算机同时完成,可用于选择育种、性状遗传解析等诸多研究工作的性状测.量。其中对贝类的体尺性状测量采用基于C撑的二维图像识别技术,识别过程分为原始图像处理、关键点查找和距离测量三个程序;软件通过串口直接读取天平数据测量贝类的重量。测量数据直接存入贝类性状数据库。经测试,系统的识别速度为3至5秒,体尺性状测量精度达到O.1毫米,体重测量精度为0.001克。本研究开发了贝类遗传育种分析评估体系,包含贝类种质资源数据库管理系统以及遗传评估系统。种质资源数据库管理系统记录和管理贝类的生长性状、繁殖性状、抗逆性状的测量数据以及

5、群体特征、养殖环境和遗传信息,这些信息是贝类选择育种、遗传性状解析的数据基础。遗传评估系统实现遗传力、重复力、表型相关、近交系数和育种值的计算,并根据使用者的定义和边界条件制定选种配种方案以指导选种。系统通过网站公告、综合查询、信息维护和网络育种四个模块来实现上述功能。该贝类遗传育种评估系统为基于Lmux服务器系统的网络软件,应用TomeS5.0为W曲服务器,前台采用XML,后台应用JSP结合MySQL数据库开发完成,可通过网络访问,方便育种场现场应用,并实现联合育种。数据模拟结果表明,该软件具有和国外畜牧育种分析软件同样的精度,而且更适用于贝类育种遗传分析。贝类选择育种的遗传评估体系已经在栉

6、孔扇贝的育种工作中应用,对33个全同胞栉孔扇贝家系进行了育种值和遗传参数计算。各个性状测量值的统计结果显示:体重的变异系数最大,壳宽的变异系数最小且明显比其他三个性状的变异系数小一个数量级。壳高、壳长、壳宽和体重的遗传力分别是0.14、0.15、O.09和0.18,均属于低度遗传力。各性状的表型相关系数和遗传相关系数都达到了显著相关水平(P<0.01,双侧检验)。比较尺寸性状与体重的表型相关与遗传相关,可以看出壳长与体重的表型相关最高,壳高与体重的遗传相关最高,均达到极显著的程度。该结果表明,扇贝育种过程中利用BLUP法计算个体育种值进行选种是准确选择优良个体的有效途径;遗传相关和表型相关的结

7、果表明通过选择壳高这一性状可以对尺寸性状和体重进行间接选择同时获得遗传进展。本研究标准化了贝类性状的测量步骤,构建了条目全面的种质资源数据库,搭建了遗传评估的计算平台,为贝类BLUP选择育种提供了充分的条件,随着数据的逐步积累,育种值和遗传参数的估算精度也将越来越高。该体系的应用将对我国贝类育种工作起到巨大的推动作用。关键词:BLUP育种遗传评估系统测量软件遗传力ResearchandConsti

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