浙江省水稻品种dna指纹数据库的初步构建及其应用研究

《浙江省水稻品种dna指纹数据库的初步构建及其应用研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、中国农业科学院硕士学位论文浙江省水稻品种DNA指纹数据库的初步构建及其应用研究姓名：程本义申请学位级别：硕士专业：农业推广·作物学指导教师：庄杰云20091201摘要为明确浙江省主要水稻品种的遗传多样性现状，利用12个DNA微卫星标记分析了浙江省近期主要的44个常规水稻品种和54个杂交水稻组合，共检测到68个等位基因，平均每个标记5．7个，变幅2---,10个；带型数共计127种，平均每个标记10．6种，变幅3"'18种；FP平均值0．752，变幅0．567～0．905。遗传多样性分析结果表明，常规品种和杂交组合均表现为亚种间遗传差异明显、亚种内遗传差异较小，

2、籼型遗传多样性高于粳型；平均遗传相似系数，常规品种籼型为0．672、粳型为0．711、籼粳间为0．103，杂交组合籼型为0．636、粳型为O．669、籼粳间为0．343。聚类分析显示，以遗传相似系数0．618为阈值将常规品种分成6类，0．601为阈值将杂交组合分成7类，且多数同类型品种或组合聚为同一类。利用前期研究建立的一套水稻品种DNA指纹检测技术体系，对2002-2006年浙江省主要的水稻品种98个、2007-2008年省区试水稻品种155个(181个次，含26个续试品种)进行了DNA指纹检测，构建了279个次水稻品种×12个微卫星标记的DNA指纹图谱数据

3、库。系统分析了指纹库中各标记的多态性和品种的相似性。基于指纹数据库，对所有品种的特异性及区试续试品种年度间的一致性进行鉴定，结果发现5组11个品种组内品种间特异性不明显，1个区试续试品种年度间鉴定结果不一致。田间种植表型验证试验结果表明，利用DNA指纹方法和构建的水稻品种DNA指纹图谱数据库进行浙江省水稻品种的特异性及区试续试品种年度间的一致性鉴定是可行的。关键词：水稻品种，微卫星标记，遗传多样性，DNA指纹库，特异性AbstractThestudywasconductedtOanalyzethegeneticdiversityofthemajorcommer

4、cialricevarietiesinZhejiangprovince．44conventionalricevarietiesand54hybridricecombinationsinZhejiangprovincewereassayedwithasetof12microsatellitemarkers．Wedetectedatotalof68allelesand127fingerprintsfromalltestedvarieties。rangedfrom2to10withanaverageof5．7and3to18with8／1averageof10．6p

5、ermarker，respectively．Thevaluesofthe丘equencyofpolymorphismrangedfrom0．567to0．905withanaverageof0．752．Theresultsofgeneticdiversitym[1alysisindicatedthatconventionalricevarietiesandhybridricecombinationsbothhadobviouslygeneticdifferenceamongsubspecies，buttheyhadlessgeneticdifferencewi

6、thinsubspecies．GeneticdiversityofindicatypeWashigherthanthatofjaponicatype．TheAGSC(averagegeneticsimilaritycoefficient)ofconventionalindica,japonicaandindica×japonicaricevarietieswere0．672，0．711and0．103，respectively．TheAGSCofhybridindica,japonica,andindicaxjaponicaricecombinationswe

7、re0．638，0．669and0．343，respectively．ClusteranalysisshowedthattheconventionalricevarietiesandhybridricecombinationsWereclassifiedinto6and7groupsrespectively,mostofvarietiesorcombinationswithsametypegatheredinto戤lnleonegroup．Atotalof98majorricevarietiesinZhejiangprovincefrom2002to2006a

8、nd155ricevarietiesi