jak2 461单体型与骨髓增殖性肿瘤的遗传易感性研究

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1、东南大学硕士学位论文JAK246/1单体型与骨髓增殖性肿瘤的遗传易感性研究姓名:冯秀申请学位级别:硕士专业:临床医学指导教师:欧阳建2012-05-23摘要JAK246/1单体型与骨髓增殖性肿瘤的遗传易感性研究背景与目的:经典的BCR/ABL融合基因阴性的骨髓增殖性肿瘤(MPN)包括:真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)和原发性骨髓纤维化(PMF)。目前对MPN分子机制的研究主要集中在获得性体细胞突变JAK2V617F。近来对MPN患者全基因组关联性分析(GWAS)显示JAK2V617F突变并不是

2、随机发生的,而是多发生于一个特定的JAK2单体型,名为46/1单体型或GGCC单体型,rsl0974944(C/G)和rsl2343867(T/C)两个位点是该单体型的标签单核苷酸多态性位点(tSNP)。目前有关中国人口的46/1单体型研究很少。MPL突变是JAK2V617F阴性MPN常见的基因变异,目前尚未有该基因多态性与MPN关系的报道。基于此,本研究拟探讨:1、JAK246/1单体型是否为MPN的遗传易感因素,并比较JAK2V617F突变与46/1单体型的关系;2、JAK246/1单体型是否影响MPN患者的

3、外周血细胞水平;3、MPL单核苷酸多态性与MPN易感性有无关系。方法:运用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)技术对77例已知JAK2V617F突变状念的MPN患者和92例正常对照人口检测JAK246/1单体型的2个tSNP(rsl0974944、rsl2343867)和9个MPL单核=(j:酸多念性位点。采用卡方检验(x2)对基因型分布统计分析,并通过Logistic回归计算比值比(0R)及其95%可信区间(CI)表示MPN患病的相对危险度,对外周血细胞水平的分布采用单因素方差分析(AN

4、OVA)。结果:1.rsl0974944、rsl2343867的野生型(CC/TT)、变异纯合子(GG/CC)、变异杂合子(GC/CT)三种基因型分布频率在对照组均分别为60.4%、4.4%、35.2%,在整个MPN组分别为39.7%、22.1%、38.2%和39.7%、25.4%、34.9%;46/1单体型两个tSNP的基因型分布在两组间存在有统计学意义的显著差异(只0.05):携带至少一个变异等位基因的个体(GC+GG/CT+CC)较野生型个体(CC/TT)患MPN的JxL险增加2.31倍,OR(95%CI)

5、分别为2.31(1.21-4.39)、2.31(1.2-4.47);携带变异纯合子者患MPN风险增加7-9倍,OR(95%CI)分别为7.54(2.27—24.99)、8.9(2.69-29.42)。2.rsl0974944、rsl2343867野生型、变异纯合子、变异杂合子对应的基因分和频率在l东南人学硕:I:毕业论文JAK2V617F阴性组分别为58.6%、6.9%、34.5%和66.7%、8.3%、25.O%,在JAK2V617F阳性组为25.6%、33.3%、41.1%和23.1%、35.9%、41%。J

6、AK2V617F阴性组与阳性组间基因型分布的差异有统计学意义(尺0.05);JAK2V617F阴性组与对照组间基因型分布不存在有统计学意义的显著差异(P>O.05);JAK2V617F阳性组与对照组间基因型分布的存在显著差异(尺0.05)。3.对MPN中的ET患者单独进行上述对应分析:rsl0974944、rsl2343867野生型、变异纯合子、变异杂合子对应的基因型分布频率在JAK2V617F阴性ET组分别为56.5%、4.4%、39.1%和66.7%、5.6%、27.8%,在JAK2V617F阳性ET组为33

7、.3%、20.8%、45.8%和29.1%、25%、45%:JAK2V617F阴性ET组与对照组间基因型分布不存在有统计学意义的显著差异(P>O.05);JAK2V617F阳性ET组与对照组间基因型分布的存在显著差异(尺0.05)。4.外周血细胞水平的单因素方差分析结果显示发生46/1单体型变异的患者较未变异的患者(CC/TT)白细胞平均水平升高(11.5608/11.5008VS15.3108/16.3779),差异有统计学意义(PO.0

8、5)。5.9个MPLSNP位点未检测到突变等位基因或最小等位基因频率(MAF)极低,基因型分布不符合遗传平衡定律。结论:JAK246/1单体型是MPN的遗传易感因素;JAK246/1单体型变异携带率在JAK2V617F阳性的MPN患者中明显高于健康人群,而JAK2V617F阴性的MPN患者较健康人群JAK246/1单体型的变异携带率无明显区别。JAK246/1单体型变异的

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