pcr-dgge法分析分娩方式对新生儿早期肠道菌群的影响

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1、东南大学硕士学位论文PCR--DGGE法分析分娩方式对新生儿早期肠道菌群的影响姓名：刘彩霞申请学位级别：硕士专业：儿科学指导教师：蒋犁2012-05-28中文摘要PCR-DGGE法分析分娩方式对新生儿早期肠道菌群的影响研究生：刘彩霞导师：蒋犁教授东南大学医学院儿科研究所【日的】生命一Lf-tJTI的肠道菌群的定植对婴儿的健埭发展起管晕大作用。本研究采用聚合酶链反应．变性梯度凝胶电泳法(polymerasechainreaction-denaturinggxadientgelelectrophoresis，PCR-DGGE)探讨利计分娩办式对7JT'h．：／LtftJ．tJtIF．s道

2、随群结构的影响。【力．}去】以32例Fd期出!I的l卜常足月儿为研究刘‘象，按分娩方式分为自然分娩纽和剖宫，_组(n_16)，分别二r生后第l天(>12h)、3天及5天采集粪便样本，抽提样本中细菌基lml当1l总DNA，并对其16SrDNAV3呵变区进行PCR扩增和DGGE测定，获得肠道蒲群分予指纹图谱，进行多样性和相似f，上等特征分析。【结果】(1)牛命早期肠道菌群定植具有个体特异性，并呈动念变化。(2)多样性分析显示：新'tqk生后第1大肠道菌群定植较少；，}i后第3天婀纰fuJ多样性无11月J,AZ-异；第5天多样下¨k⋯t-e-．数H’在剖宫产组和f．1然分娩7lt-5)'S

3、JlJ为1．47钍0．560、1．920-生0．290，优势度指数D分别为0．699-J：0．172、0．8214-0．056，两组比较均有统计学差异(P<0．05)，lllJi_s]_纣【H’、D均低J：f．I然分娩组。(3)s；J积,-l相似性分析：!卜后第3灭，JJj弘、N[t，fL5,性系数Cs4：剐#矿：组及fj然分娩组内Cs分别为0．584(O．395．0．631)、0．214(O．091—0．364)：剖宫产组内Cs值<0．30的占该组总Cs值个数的21．4％，而自然分娩组内Cs<0．30的占该组76．0％，曲组比较均仃统汁学差异(P

4、衍j情况比较无明显差异。【结论】生命早期肠道蔺群定植具囱．个体特片性，并鼙动念变化。尘后第3天剖宫产个体之问表现出更高的肠道茼群结构相似性，第5天剖宫产儿肠询柳晰t

5、l类及数^}均落后于自然分娩儿，分娩方式影响了生命frI．期正常肠道菌群结构的建jZ。PCR—DGGE法在新，卜儿肠道菌群结构多态性及演进变化方面提供了更洋尽的资料。【关键词】新：卜儿；肠道菌群：分娩力‘』弋；变’h梯度凝胶f乜泳(DGGE)英文摘璎AbstractImpactofModeofDeliveryonIntestinalMicrobiotainEarlyNeonatesbyPCR·DGGEGraduate：L

6、iuCai—xiaSupervisor：Prof．JiangLiMedicalSchoolofSoutheastUniversitylObjectivelTheearlycompositionofintestinalmicrobiotaplaysallimportantroleinneonatesforhealthydevelopment．ThisstudyWaSdesignedtoinvestigatetheeffectsofmodeofdeliveryontheearlygutmicroflorabypolymerasechainreaction-degenerationgrad

7、ientgelelectrophoresismethod(PCR-DGGE)．【MethodsJ32normaltermneonateswereenrolledinthestudy(includingvaginaldeliverygroupandcaesareansectiongroup，eachgroupincluded16neonates)，fecessampleswerecollectedatthefastday(>12h)，3-dayand5-dayafterbirth．AfterbacterialDNAswereextractedfromthefecesoftwogroup

8、s，bacterialcommunitiesintwogroupwereexaminedbyPCRof16SrDNAV3regionanddenaturinggradientgeleleclrophoresis(DGGE)．AfterDGGEprofilingswereobtained，thediversityandsimilarityrelatedindiceswereusedtoanalyzediversitydifl打encesofthegutbac