深圳市龙华区一起输入性登革热疫情的分子流行病学研究

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1、深圳市龙华区一起输入性登革热疫情的分子流行病学研究许少坚任燕赖晓玲赵琼全德甫蔡妙森陈宏标周小峰方捷甘中胤罗经伟周世权刘丽珍彭伟M王金明林启辉深圳市龙华区疾病预防控制中心龙华新区传染病预防控制重点实验室摘耍：目的对2017年深圳市龙华区一起输入性登革热病原体进行分子遗传学分析。方法利用C6/36细胞从病人血清中分离登革热病毒(Denguevirus,DENV),对分离得到的DENV的E基因进行测定和系统发牛树构建，结合现场流行病学资料对其分子遗传学进行分析。结果成功分离得到1株DENV-1,命名为SZUh7JB00855£17°E基因的扩增获得两条目的产物，分别为1010b

2、p和829bp。目的产物经测序拼接后，最终得到长为1485bpDNA序列;NCBI数据库多序列在线比对结果显示SZLHJJB008552017毒株E基因与越南2007、2008及2011年分离毒株E基因序列的覆盖率在99%100%之间；系统发牛树分析结果显示，SZLHJJB008552017与VNBID-VI686/2007、VNBID-V1691/2007、VXBID-V3908/2008>VNBID-V3909/2008、VN09DX879/2011亲缘性最近，与近年来广东省各地市暴发的分离株亲缘性较远。结论现场流行病资料和实验室分子遗传学分析都提示本案例报告的登革热

3、病例属于输入性病例，输入地极有可能是越南。关键词：登革热病毒;系统发生树构建;进化分析;作者简介：许少坚(1984—),男，硕士，技师，研究方向:病毒性传染病病原谱监测及进化分析。作者简介：林启辉，E-mail:294769403@qq.com收稿日期：2017-08-29基金：深圳市科技创新基金项冃(No.20150402162704224)MolecularepidemiologicstudyonanimporteddenguefevercaseinLonghuaDistriet,ShenzhenXUShaojianRENYanLAIXiaolingZHAOQiong

4、QUANDefuCAIMiaosenCHENHongbiaoZHONGXiaofengFANGJieGANZhongYinLUOJingweiZHOUShiquanLIULizhenPENGWeijunWANGJinmingLINQihuiLonghuaDistrietCenterforDiseaseControlandPrevention,DistrietKeyLaborstoryforInfectiousDiseasePreventionandControl,Shenzhen;Abstract：ObjectiveToconductamoleculargenetican

5、alysisofthepathogenofanimporteddenguefevercaseinLonghuaDistrictofShenzhenCity.MethodsByusingC6/36cells,Denguevirus(DENV)wasseparatedfromthepatientserum,thesequenceoftheEgenesofDENVobtainedwasdeterminedandthephylogenetictreewasconstructed,andthenamoleculargeneticanalysiswasdoneincombinatio

6、nwiththeonsiteepidemiologicalinfonnation.ResuItsOnestrainofDENV-1wassuccessfullyseparatedandnamedasSZLH17JB008552017eAfteramplification,twotargctproductswereobtained,whichwere1010bpand829bp,respectively.Aftersequencing,theDNAsequencewas1485bp.NCBIdatabasemulti-sequenceonlinecomparisonshow

7、ed:thecoverageoftheEgeneoftheSZLHi7JB008552017strainandthatinVietnamisolatedin2007,2008and2011between99%and100%.ThephylogenetictreeanalysisshowedthatSZLH17JB008552017wastherelativelyclosesttoVNBID-V1686/2007,VXB1D-V1691/2007,VXBID-V3908/200&VNBID-V3909/2008andVN09DX