研究生论文：樟科和忍冬科的dna条形码筛选研究

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1、湖北中医药大学硕士学位论文樟科和忍冬科的DNA条形码筛选研究姓名：刘震申请学位级别：硕士专业：中药学指导教师：陈科力20100527中文摘要目的：通过对四条不同的DNA片段(psbA-trnH,171a必rbcL，和ITS2)进行筛选，寻找适合樟科和忍冬科植物鉴定的DNA条形码序列。方法：使用psbA-trnH,rbcL、1"11atl(和核ITS2的通用引物对樟科和忍冬科植物进行PCR扩增和测序，比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异，进行barcodinggap分析，采用BLASTl和NearestDiStance方法评价不同序列的鉴定能力。结果：所采集试验样本及拓展分析

2、数据相结合，使用BLASTl的方法对樟科植物35个属，117物种，175样本的研究发现，psbA-trnH序列在樟科植物中的鉴定成功率在种水平上为84．0％，属水平上为92．3％。而在忍冬科13个属32个物种54个样本中，ITS2的鉴定成功率最高，物种水平上为96．3％，属水平为100％。结论：叶绿体间隔区psbA-trnH序列可以作为樟科植物的DNA条形码候选序列，而ITS2序列可以作为忍冬科DNA条形码的候选序列，同时我们推荐psbA-trnH序列作为忍冬科植物DNA条形码鉴定的补充序列。关键词：DNA条形码；樟科；忍冬科；psbA-trnI毛,m8瑙rbcL；ITS2Ap

3、pIicationofDNAbarcodinginthePIantsofLauraceaeandCaprifoIiaceaeramiIYSpeciaIity：ScienceofChinesemateriamedicaAuthor：ZhenLiuTutor：Ke-IithenAbstractObjective：ThiSStudyaimstodeterminethecandidatesequencesthatcanbeusedasDNAbarcodeinLauraceaeandCaprifoliaceaefamily．Methods：PCRamplification，sequenc

4、ingefficiency，differentialintra—andinter—specificdivergences，DNAbarcodinggap，andidentificationefficiencywereusedtoevaluatethefourdifferentDNAsequencesofpsbA—trnH,matK。fbcLandITS2．Results：①Thedisetiminationabi1ityofpsbA—trnHin175plantsamplesbelongingto117speciesfrom35diStinctgeneraofLauraceae

5、wastested．ItwasfoundthattherateofsuccessfulidentificationwithpsbA-trnllwere84．0％and92．3％atthespeciesandgenuslevel，respectively．②WetestedITS2regionforitssuitabi1ityasDNAbarcodesofCaprifoliaceaefamilyacross54samplesbelongingto32speciesfrom13genera．TheITS2whoserateofsuccessinidentificationingen

6、eraleveliS100％andinspeciesiS96．3％．Conelusion：Bycomparing／Yat＆rbcLandITS2，itwasfoundthatthepsbA—。trnHregioniSthebestmarkerfortheidentificationofLauraceaespecies．TheITS2canbeusedasacandidatesequenceofDNAbarcodetoidentifythespeciesinCaprifoliaceaefamily，andpsbA—trnHasacomplementarybarcodetoITS2

7、forCaprifoliaceae．ⅡKeyWords：DNAbarcoding；Lauraceae；Caprifoliaceae；psbA——trnl鸶,Illaf噩rboL；ITS2Ill湖北中医药大学学位论文原创性声明本人声明：所呈交的学位论文是在导师的指导下进行的研究工作及取得的研究成果。除了论文中特别加以标注和致谢的地方外，本论文不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得湖北中医药大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。对本文的研究做出贡献的个人和集体，均已在