山羊lpl基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析

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1、AnhuiAgriculturalUniversityMasterDegreeThesisAnalysesofMolecularGeneticPolymorphismsoftheLPLGeneandTheirAssociationswithIntramuscularFatContentinGoatsPostgraduatecandidate:YinJieAcademicsupervisor:Prof.JingJianpingCo-supervisor:LecturerLingYinghuiCollegeofAnimalScienceandTec

2、hnology,AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei,230036Hefei,Anhui,ChinaJune,2014万方数据项目资助1.国家自然科学基金项目：调控山羊卵巢雌激素和孕酮的相关miRNA的鉴定及作用机制研究(编号：31372310)2.国家自然科学基金项目：miR-27b介导Pax3基因调控山羊骨骼肌细胞增殖与分化研究”(编号：31301934)3.国家高技术研究发展计划（863）计划项目：牛羊分子细胞工程育种技术创新与优势性状新品种培育（编号：2011AA100307）4.安徽省自主创新专项：高产优

3、质肉用山羊选育及规模化生产技术示范(编号：12z0102044)5.安徽省自主创新专项：安徽白山羊新品系扩繁、选育及应用(编号：13Z03049)6.安徽省自然科学基金项目：miRNA-1和miRNA-133调控山羊骨骼肌生长发育的功能研究（编号：1308085QC54）。万方数据独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得安徽农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究

4、所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：时间：年月日关于论文使用授权的说明本人完全了解安徽农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意安徽农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名：时间：年月日第一导师签名：时间：年月日万方数据摘要脂蛋白脂酶（Lipoproteinlipase，LPL）基因是一种在脂肪代谢过程中起关键作用的蛋白水解

5、酶。LPL基因已被看做是影响IMF的候选基因。提高山羊脂肪沉积能力，有利于获得与山羊肌肉脂肪性状相关的标记位点。本研究选用安徽白山羊、波尔山羊、马头山羊、济宁青山羊、岷山黑裘皮羊、临朐奶山羊等6种山羊群体为试验动物，采用PCR-SSCP分析方法研究LPL基因的多态型，并运用GLM模型，对检测出来的的SNP及其与羊IMF的关联分析。1.根据GenBank上公开发表的相关山羊LPL基因，设计引物P1-P10，应用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上发现P1-SSCP多态位点，该位点上具有五种基因型AA、BB、AB、AC和BC。序列测定结果表明，P

6、1-SSCP的变异是由碱基G→287A的替换造成的。在P6-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、BB、AB。序列测定结果表明，P6-SSCP变异是由碱基G→16997A的替换造成，Gln→Ser。在P7-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、BB、AB。序列测定结果表明，P7-SSCP变异是由碱基A→18313C替换造成，导致Asp→Ala。2.在上述6个群体中分析了PCR-SSCP位点的基因型分布情况，Hardy-Weinberg检验结果表明：在P1-SSCP位点上，除安徽白山羊之外，所有品种均达到Hardy-Weinberg平衡（P>0.

7、05）。在P6-SSCP位点和在P7-SSCP位点上，所有品种均达到Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。3.根据SNP群体动力学分析，287G、18313A在6个群体中分布均较稳定，16997G在群体中表现一定特异性，安徽白山羊分布达0.9750，波尔山羊0.8828，马头山羊0.8333，临朐奶山羊0.7500，济宁青山羊0.7037，岷山黑裘皮山羊中分布率最低是0.6979。G-16997A与IMF呈负相关性；A-18313C位点与IMF显著相关联（P<0.05），这说明P7位点处A-18313C与脂肪沉积能力有相关性。关

8、键词：山羊；LPL基因；遗传多态性；肌内脂肪含量I万方数据AbstractLipoproteinlipase(LPL)playsamajorrolei