中国hiv-1vpr基因多态性检测及其和临床aids发病特点相关性

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1、分类号VDC密级博士学位论文中国HIV一Ivpr基因多态性的检测及其与临床AIOS发病特点的相关性ChineseHIV-1vPrgenediversitydetectiona拜ditseorrelationwithCliniealeharacteristiesofAIDS作者姓名:张春迎学科专业:内科学(传染病)学院(系、所):湘雅二医院指导教师:郑煌煌教授论文答辩日期叮.‘.公答辩委员会主席中南大学二零零八年五月原创性声明本人声明，所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果

2、。尽我所知，除了论文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中南大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在在论文中作了明确的说明。作者签名:泌匹一-日期:工年、月二日关于学位论文使用授权说明本人了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定，即:学校有权保留学位论文，允许学位论文被查阅和借阅;学校可以公布学位论文的全部或部分内容，可以采用复印、缩印或其它手段保存学位论文;学校可根据国家或湖南省有关部门规定送交学位

3、论文。作者签名:侧醚些。师签:一军一年上月二日‘啤珍期博士学位第一部分中文摘要第一部分川v-1vpr基因多态性及其进化树的分析摘要目的:分析来自中国各地区的HIV一1感染者的vPr基因序列，HIV一Ivpr多态性在人群中的具体分布情况，从分子流行病角度描述vpr基因变异的基本特征，比较中国各地区HIV一1vPr基因的变异位点的自身特点以及与国外以往研究的异同。结合感染者的疾病特点及临床资料，挑选出有临床意义的变异，为进一步研究HIV一1vPr基因变异的功能意义、作用机理及其与感染者临床病情的关系打

4、下基础。方法:提取348例HIV一1感染者血浆病毒朋A，运用逆转录聚合酶链式反应(RT一PCR)及巢式PCR(nestedPCR)的方法进行HIV一1vpr基因的扩增，经1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定后送公司测序。用Blast、ClustalW、Mega4.0、DNAsp4等相关生物分析软件进行vpr基因核昔酸和Vpr蛋白质序列分析，并构建进化树，分析中国HIV一1感染者的vPr基因的多态性特征、变异特征和亚型的分子流行病学特征。并将感染者的相应临床资料如传播途径、性别、年龄、病毒水平高低、淋巴细胞亚

5、群的升降及临床病程的进展情况与上述结果综合起来，进行对比分析，观察HIV一1vPr基因不同变异位点可能导致的不同的临床表现。结果:HIV一Ivpr基因序列结果分析显示:一、AB型多见于男性双性恋和同性恋感染者;AE和BC亚型主要见于男性感染者，其传播途博士学位第一部分中文摘要径主要为异性性传播和静脉吸毒;而B亚型主要见于女性感染者，其中以异性间传播占60.7%;C亚型主要见于男性，其传播途径与AE亚型相似，仍以异性和静脉吸毒为主。各VPr亚型间患者年龄没有显著区别，主要是以青壮年为主。二、观察到一

6、些Hlv一1vpr亚型特异性氨基酸位点。比如，R3，，N3，，H“，V‘8，T63，Y，2只在亚型B/AB中发现，而R3，Q，‘，G“，V，。，沪则在亚型C/BC中发现，而G6，I‘0，Q86，GS，，589则主要见于AE亚型。观察到VPr氨基酸序列有9个位点高度变异，变异率大于20%，分别是第8，48，55，63，70，84，85，86，94位。通过对核昔酸分析显示，完全保守的位点有98个约占33.68%，简约信息位点和单一变异位点分别为135和41。三、还观察到H工v一1vPr第55、63、7

7、0、85、86、89、94位氨基酸的变异可能与感染者临床表现相关，并有待进一步研究。结论:1.发现vPr基因各亚型在传播途径和男女比例方面各有所不同，与资料显示的env基因亚型与传播途径和男女比例的关系大致相似。2.首次发现一些vPr基因亚型特异性的氨基酸位点。3.首次分析了中国感染者的HIV一IvPr基因进化树的特征。4.首次发现中国感染者HIV一1Vpr氨基酸序列的第55、63、70、85、86、94位等变异可能与感染者的临床表现有关，但没有发现VPr77Q和临床表现的明显关系。关键词人类免疫

8、缺陷病毒，vPr基因，病毒蛋白R，基因多态性，基因进化树博士学位论文第一部分英文摘要ABSTRACTobjeetive:TheviralProteinR(VPr)ofhumamimmunodefieieneyvirustyPe一l(HIV一l)15asmallbasieProtein(14kDa)of96aminoacids，and15welleonservedinHIV一l，扭V一2andSIV.TheroleofVPrinthePathogenesisofAIDS15unden