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1、基于SPM的任务态fMRI分析实验介绍这是一个由反复刺激完成的事件相关fMRI实验。有2x2个因子:名人和非名人的面孔在黑白间隔的棋盘格背景上分别呈现两次,同时要求被试辨认并按键。因此有4个感兴趣的事件类型,分别是非名人和名人的第1、2次呈现,分别计为Nl、N2、Fl、F2O这些事件的开始吋间信息被记录在sots,mat文件里。1stpresentation2ndpresentation4.0s+Non-famousFamous数据预处〕预处理前首先要采用SPM的D1C0MImport模块进行格式转换,然后进行数据预处理,预处理结束后保存最后一步平滑后的图片以及空间配准
2、txt文件,然后进行建模分析。先安装matlab7.1以上版木,然后将spm8文件夹放在matlab安装目录中,我们一般放在toolbox文件夹中,然后启动matlab用菜单中设置路径命令(File>SetPath...)增加spm8的路径并保存。之后我们运行命令:spmfmri,这样将打开spm8的操作界面,如下图。我们称左上侧的窗口为按钮窗口(buttonwindow),左卜•侧的窗口为输入窗口(inputwindow),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(TreeBuildingWindoworthegraphicswindow)o1:Realignment即使我
3、们对被试的头部做了很好的固定,在实验过程中,被试也会不由自主的冇一些轻微的头动,这在fMRI实验屮尤为明显。这一步就是把一个实验序列屮的每一帧图像都和这个序列的第一桢图像按照一定的算法做对齐,以矫正头动。做完这一步,能给出该序列中被试的头动情况,以作为是否放弃该数据的依据,如果头动超过1个voxel(功能图像扫描矩阵一般是64*64,则体素的大小为(F0V/64)*(F0V/64)*(层厚+层间距)),则要考虑放弃该时间点数据。该程序利用最小二乘法(leastsquaresapproach)原理和含6个参数(刚体模世)的空间变换,对从一个被试获取的吋间序列进行校正。用户
4、可指定某个volume作为随后volumes的参考。可以是第1个volume,也可选择比较有代表性的volume(更明智的选择),例如选择磁场相对稳定的第4个volume。校正信息(头动信息)将在结果窗口(GraphicsWindow)显示。每个Session的校正信息将存储为rp*.txt,其中*为Session数据集名称。另外,头动校正信息将以plot图形显示。如下图:Translation表示被试头部在X,Y,Z三个方向的平移,分别用蓝,绿,红三种颜色表示。Rotation表示被试头部在实验过程当中绕X(I厂R),Y(A-P),Z(S-1)三条轴的传动角度。横坐标
5、代表这个序列所采集的所冇图像,纵坐标表示的是偏移量和偏转角度,分别以毫米和度为单位。采用SPM8,头动信息和空间标准化的图形文件将以spm_udata,J・ps的形式保存于matlab的工作目录下,如我们是2014年3月17日处理的数据,则将以spm_2014Marl7.ps文件存于matlab的work目录下。translationrotation我们在预处理面板校准选项小选择uRealign(Est&Res)”,出现如下对话框,我们按下面设置进行:BatchEditor丽毛EditgPMgasicIOJoyExampleTdh[►Realiqn:EstimafMod
6、uleListCurrentModule:Realign:Estimate&Reslice
7、HelporrRealign:Estimate&Re引iceZData<-XEstimationOptionsQuality0.9Separation4Smoothing(FWHM)5NumPasses...rtomeanInterpolation...B-SplineWrappingNowrapWeightingResliceOptionsReslicedimages・..8nImage—Interpolation・.・B-SplineWrappingNowrapCurrent
8、Item:DataNew.SessionEdtVatueI<1I±JJDataAddnewsessionsforthissubject.Inthecoregistrationstep,thesessionsarefirstrealignedtoeachother,byaligningthefirstscanfrom—eachsessiontothefirstscanofthefirstsession.Thentheimageswithineachsessionarealignedtothefirstimageofthesession.Th