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时间:2018-12-24
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1、基因工程实验流程植物总DNA的提取(作为PCR的模板)质粒的提取与酶切检测(pET28a及pET28a-SRP)PCR产物从琼脂糖凝胶上的回收PCR产物与T载体的连接6月23号6月24号6月25号PCR产物及pET28a双酶切、纯化回收(电泳、凝胶回收)原核表达载体的诱导表达及目的蛋白的检测6月27号6月29号重组载体转化大肠杆菌DH5α阳性克隆检测——菌落PCR6月26号6月28号目的基因的克隆(PCR扩增)PCR双酶切回收产物与pET28a载体的连接(连接后可在4C保存)重组载体转化大肠杆菌M15或DL21重组载体的检测——菌落PCR、双酶切等6月30号-7月2号实验一丹参总DNA的
2、提取实验目的:掌握从植物或动物的组织(细胞)中抽提DNA的方法。实验材料:丹参叶片实验器材:台式离心机,恒温水浴锅,电泳仪,研钵和杵,离心管,微量移液器,枪头实验步骤:第一次使用前请先在漂洗液WB和结合液PQ中加入指定量的无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!取所需适量裂解液PL放置在65℃预热,使用前加入β-巯基乙醇到终浓度2%。1.取适量植物组织(新鲜组织100mg或干重组织30mg)在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。2.转移细粉到一个1.5ml离心管,不要解冻,加600μl65℃预热的裂解液PL(确认已加入β-巯基乙醇至2%),剧烈涡旋振荡混匀,用大
3、口径枪头轻柔吹打帮助裂解。如果组织裂解困难,可根据需要加一个轻柔匀浆10秒的步骤帮助裂解。3.65℃水浴20-60分钟,在水浴过程中颠倒离心管以混合样品数次。可选如果组织干燥或者产量低,可以适当延长水浴时间。如RNA残留多,可在水浴前加入6μlRNA酶(20mg/ml)。4.加入700μl氯仿/异戊醇(体积比24:1混合),颠倒充分混匀几分钟(或者涡旋混匀),13,000rpm离心5分钟。若提取的植物组织富含多糖多酚,可以在第4步前用等体积酚/氯仿(1:1)抽提一遍。5.小心吸取上清到一个新的1.5ml离心管,注意不要吸到界面物质。如上清比较浑浊,则需要重复步骤4一遍,直到得到透亮上清。
4、6.较精确估算上清量,加入1.5倍体积结合液PQ(请先检查是否已加入无水乙醇!)后立刻涡旋,充分混匀。此时可能出现沉淀,但不影响实验结果。7.将上一步所得混合物(包括可能出现的沉淀)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放-5-入收集管中)13,000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液(先加700μl离心,弃废液,再加入剩余的溶液,再次离心)。8.加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm离心30秒,弃废液。9.加入700μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm离心30秒,弃掉废液。10.加入500μl漂洗液WB,12,000rpm离心30秒,弃掉废液。11.
5、将吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。12.取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在65-70℃水浴中预热),室温放置3-5分钟12,000rpm离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000rpm离心1分钟。洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果预计和需要产量高,可增大洗脱体积,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于50μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。13.DNA可以存放在2-8℃,如果要
6、长时间存放,可以放置在-20℃。按照植物总DNA提取试剂盒操作说明。1%琼脂糖凝胶电泳检测注意事项:1.所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机,如Eppendorf5415C或者类似离心机。2.开始实验前将需要的水浴先预热到65℃备用。3.需要自备氯仿/异戊醇(体积比24:1混合)、无水乙醇和β-巯基乙醇。4.结合液PQ和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤、眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。5.不同来源的植物组织材料中提取DNA的量会有差异,一般100mg新鲜组织典型产量可达3-25μg
7、。6.洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。实验结果:本组实验结果是第九孔和第十孔,其中第九孔的DNA提取效果较第十孔提取效果好。两空之间的差异可能是由于两个离心管中添加的植物量不一样,所以最后提取的量不一样。实验结果分析:1.在液氮研磨叶片的时候,研磨不够充分,且在向离心管中添加的时候,添加的量不多,速度慢,导
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