《荧光定量操作》word版

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1、样品取回后,冻于-70冰箱中。样品包括组织样和血清样品。检查目的基因的表达情况。需要作的工作如下:1、首先是组织总RNA的提取。提取步骤见TRNZOL试剂说明书。2、组织mRNA提取后进行反转录,得到cDNA样品。3、以CDNA样品为模板进行特定基因的扩增(可先用普通PCR验证/为了验证表达的差异,应采用定量PCR,并选用内参基因)注意:为了让提取的RNA质量可靠,每次研磨的组织样品不能过多,这就要求我们在取样是不能取太多的样品,而且所取样品必须准确、可靠。否则会导致后续试验都不准确。一.总RNA提取准备工作:、(一)基本器材和

2、试剂1.实验器具与材料(1)移液枪:1ml、200ul、10ul(2)枪头:1ml、200ul、20ul(3)枪头盒:1ml一个,200ul和20ul的枪头盒至少一个(4)EP管1.5ml、100ul(5)研钵:据一次提取RNA样品多少定.(6)容量瓶:1000ml(7)盐水瓶:100ml(8)广口瓶几个(配75%乙醇,盛放氯仿,异丙醇等用)2.实验器具的处理与准备(1)塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于0.1%DEPC水中(必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压锅灭菌(121-126℃

3、)至少30分钟,后在60-70℃烘烤箱中烘干,试验前将枪头放入枪盒。优级耗材可直接使用。(2)玻璃制品:(主要是玻璃研磨器)先泡酸过夜,冲洗干净后,在0.1%DEPC水中泡8小时左右(过夜),37℃烘干,用蒙锡纸包裹送至干烤(100-200℃)3次。(3)金属制品:(镊子等)先洗干净,再送干烤3次。(不需要泡DEPC水)3.试剂配制和准备(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。DEPC处理水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40u

4、lDEPC,37℃过夜,送至高压去除未反应的DEPC。(2)75%乙醇(最好在抽提时现配):用无水乙醇和DEPC水配制(DEPC水:无水乙醇=1:3),然后放于-4℃预冷备用。(3)异丙醇:放入棕色瓶。(4)氯仿:放入棕色瓶。(5)Trizol:100ml/瓶存放于4℃。4.抽提RNA工作台面准备1.在仅用于RNA抽提的超净工作台抽提RNA2.工作台面用用RNAase失活剂处理。(二)总RNA提取步骤:1.采样样品采集需均一,迅速,组织样品避免血液污染,样品采集后迅速置于液氮或是-70℃.2.样品的研磨:先用少许液氮将研钵冷却,

5、然后取少许组织样放于盛有液氮的研钵内迅速研磨成细粉末,取约少100mg样品于预先加入1mlTrnzol的EP管中,用力颠倒混匀,室温静置5分钟,充分裂解细胞。3.加入氯仿向每管中加0.2ml氯仿。盖紧管盖,用漩涡振荡仪振荡15s(也可用手用力振荡1分钟左右),使其充分混匀,静置2-5min。4.离心分离4℃下12000g离心15分钟,样品会分成三层:黄色的有机相,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(约500μl)转移到新管中,注意不要吸取到蛋白层。5.转移上清将含有RNA的上层清液转移到新的1.5mlEP管中后(

6、约500ul),再加入0.5ml异丙醇,轻轻混匀后静置10分钟6.RNA沉淀然后4℃12000g离心10分钟,弃上清。离心前RNA沉淀经常是看不见的,离心后在管侧和管底形成白色胶状沉淀。7.RNA洗涤加入1ml75%乙醇(4摄氏度预冷),轻轻洗涤沉淀,4℃,7500g×5min,弃上清。注意在倒出液体时不要倒出沉淀,剩余的少量液体短暂离心,然后用枪头吸出,注意不要吸弃沉淀。此步可重复.8. 晾干室温放置晾干(不要晾的过干,RNA过分干燥后会很难溶解,大约晾干2-3分钟左右,见乳白色沉淀变成透明胶冻状即可)9.溶解根据实验需要及得

7、到RNA量的多少,加入30-100μl无RNase水,反复吹打、混匀,充分溶解RNA。为了保证RNA的浓度在可用范围,可使用20-30μl水溶解。若浓度过大可再稀释。预防RNase污染,应注意以下几方面:1.经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。2.使用无RNase的塑料制品和枪头避免交叉污染。3.RNA在TRNzol试剂中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料器皿可在0.5MNaOH中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌

8、,即可去除RNase。4.配制溶液应使用无RNase的水。(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1%(v/v),放置过夜,高压灭菌)。TRnzol法抽提总RNA流程图液氮研磨组织并取样约100mg,加入预先盛有1mlTRnzol的EP管中振荡混匀后

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