《余功臣分子克隆》word版

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1、分子克隆技术实验报告应用生物技术08012008304201308余功臣2011年5月22日说明实验是由小组成员集体完成,实验报告以及结果分析由个人完成。小组成员:余功臣、晏星、何一鸣、伍良伟。试验时间由2011年5月8日至5月14日,共完成分子克隆、分子杂交和基因表达检测三大部分的实验。下列实验报告中的实验试剂具体成分以及配置方式均未列出,详见《分子克隆技术实验手册》附录。一.将M812载体上的水稻DNA片段亚克隆于pUC19载体上摘要运用碱裂解法抽提质粒载体pUC19和带有水稻目的DNA片段M812的质粒p

2、U1301,用琼脂糖凝胶电泳检测所提取的质粒DNA的质量,用限制性内切酶BamI和KpnI处理pU1301和pUC19,将纯化的载体pUC19与回收的水稻DNA片段M812连接后,将重组的DNA分子导入感受态细胞大肠杆菌菌株DH5a并在培养皿上培养。关键词碱裂法琼脂糖凝胶电泳检测亚克隆感受态细胞重组子的转化1前言亚克隆,即是将已经获得的目的片段进行进一步分析,或者进行重组改造等过程。其基本过程包括:(1)目的片段和载体的制备;(2)目的片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。本实验中的目的片段

3、和载体均来自细菌质粒,因此细菌质粒的抽提是目的片段和载体制备的核心步骤。本实验中以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。碱裂解法,是1979年由Birnboim和Doly设计并发表的经典质粒DNA提取方法。其核心原理是在碱性条件下线状DNA发生变性,质粒DNA维持环状。在高盐条件下作复性处理,变性的染色体会沉淀,从而将质粒DNA与染色体DNA分开。在pH值为8.0-8.3时,核酸分子带负电,在电泳时由负极向正极移动。采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分子筛的作用下,分子大小和构像不同的核酸分子泳动率出现较大的

4、差异。核酸分子中嵌入荧光染料(如EB)后,在紫外灯下可观察到核酸片段所在的位置。琼脂糖凝胶电泳由于其操作简单、快速、灵敏等优点,已成为分离和鉴定核酸的常用方法。所抽提的质粒即用电琼脂糖凝胶电泳来检测。一般所抽提的质粒在琼脂糖胶上能够呈现三条带,因为质粒有三种构型,即线状、环状、开环状。将所获得的载体质粒与带有目标片段的质粒进行重组,其包括载体及外源DNA片段的双酶切消化、目的片段的回收和载体的纯化、目的片段与克隆载体的体外连接、重组子的筛选和鉴定等内容。DNA片段的克隆技术是分子操作的核心部分。将重组DNA导入

5、大肠杆菌细胞一般有两种方法——CaCl2法和电转化法,本实验中采用CaCl2法。本实验采用CaCl2法制备感受态细胞:利用冰冷的CaCl2处理对数生长期的细胞,可以诱导其产生短暂的“感受态”,易于摄取外源DNA。转化效率为106~107转化子/mgDNA。2材料和方法2.1用碱裂解法抽提质粒2.1.1实验材料2.1.1.1菌液携带pUC19质粒载体的大肠杆菌菌液携带含有水稻DNA片段的pU1301载体的大肠杆菌菌液。2.1.1.2培养基携带pUC19质粒载体的大肠杆菌和携带含有水稻DNA片段的pU1301载体的

6、大肠杆菌的培养先采用含相应抗生素的LA培养基,后采用LB培养基。大肠杆菌菌株DH5a采用LB培养基。大肠杆菌在37℃培养。抗生素的使用浓度:氨苄青霉素,100µg/ml;卡那霉素,50µg/ml。2.1.1.3实验试剂SolutionI;SolutionII;SolutionIII;苯酚/氯仿;异丙醇;ddH2O22.1.2两种载体的抽提步骤1.取含有所需载体的大肠杆菌菌液于含有相应抗生素的LA培养基上涂布或划线分离单菌落,37℃过夜培养;2.用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有相应抗生素的LB培养基中,37℃摇床

7、~250r/min过夜培养;3.吸取1.5ml菌液,12000r/min离心1分钟,倒掉菌液;吸取1.5ml菌液,再次12000r/min离心1分钟收集菌体,尽量将菌液倒干净;4.加入300ml溶液I,振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底打匀沉淀或碎块);5.加入300ml溶液II,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过5分钟(最好不超过2分钟);6.加入300ml溶液III颠倒混匀,放置于冰上10分钟,使杂质充分沉淀;7.12000g离心10分钟;8.吸取800ml上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)

8、至另一Eppendorf管中,加入2/3体积的异丙醇,室温下放置5分钟;9.12000g常温离心15分钟;10.倒尽上清,加500ml75%乙醇浸洗除盐,(放置片刻后倒去上清;或离心5分钟)11.加40ml灭菌超纯水溶解;12.质粒的质量检测,-20℃保存。2.1.3DNA的琼脂糖凝胶电泳步骤1.将洗净、干燥的制胶板放入制胶槽中,水平放置在工作台上,调整好梳子的高度;2.称取0.24g

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