实验25动物细胞线粒体及线粒体dna的制备

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1、实验25动物细胞线粒体及线粒体DNA的制备、酶切图谱分析实验目的:了解并掌握细胞线粒体(mitochondria)的提取原理及操作方法;丫解线粒体DNA的限制性片段长度多态性(RFLP)分析技术的原理及操作方法。实验原理:线粒体是真核细胞中产生能量的重要细胞器。细胞中的能源物质一脂肪、糖、部分氨基酸在此进行最终的氧化,并通过偶联磷酸化生成ATP,供给细胞生理活动之需。对线粒体结构与功能的研究通常是在离体的线粒体上进行的。1、线粒体的获得细胞器的游离:细胞器的游离需要破碎细胞,破碎细胞常用的方法有化学法和机械法。化学法有渗透压作用、酶水解、自溶、冻融等几种类型

2、。渗透压作用是利用低表妞张力使细胞膜破碎,其作用温和。自溶法是利川生物自生的活细胞内含有各种大量的消化酶,它们能将细胞膜洛解掉,同时也可能将线粒体膜溶解而使线粒体DNA释放出來。冻融法是利用冻结和溶解的双重作用,其作用可能会造成细胞膜和有膜结构的细胞器的破裂,其作用较为剧烈。机械法有研磨破碎、均质机破碎、超声波破碎和匀浆器破碎。研磨破碎是利用盘磨研磨剪切破碎,作用中等。均质机破碎是用电带动刀片进行剪切组织器官,其作用较剧烈,基本能够将组织器官破碎。超声波破碎是随机地将组织细胞打成各种大小不同的片段,其作用非常剧烈。匀浆器破碎是一种手动的方法,由于匀浆器容器壁

3、较为粗糙,通过相互的摩擦,基本能将细胞膜磨破,其•作用温和。要获得较为完整而大:W:的线粒体,通常用STE抽提缓冲液浸泡材料并用玻璃匀浆器或研钵研磨破碎。线粒体的粗提:由于动物细胞的线粒体较小(15〜19kb),而真核细胞及其碎片、蛋白质沉淀物都比较大,所以用差速离心的方法可以将它们分离开来。差速离心法又叫分级离心法,是当非均一粒子(大小、密度各不相同)的悬浮液被离心时,各种粒子将以各自的沉降速率移至离心管底部,逐步在管底形成沉淀。为了分出特定组分,需进行一系列离心。首先选择一个离心速度和离心时间,第一次离心时把大部分不需要的更大粒子沉降去掉。这时所需要的组

4、分大部分还留在上清液中,又选择第二个离心速度和离心吋间,使大部分不需要的更小的粒子留在上清液。去掉上清液后,添加相同介质把沉淀悬浮起来,重复上述的差速离心,反复几次,直至达到所需要的粒子纯度为止。一般去细胞碎片及杂质的离心力(500〜2000g)和离心时间(5〜15min),沉淀线粒体的离心力(12000〜20000g)和离心时间(20〜40min)。2、线粒体的鉴定JanusGreenB是对线粒体专一的活体染料,具有脂溶性,能跨过细胞膜,有染色能力的基团带正电,结合在负电性的线粒体内膜上,内膜的细胞色素C氧化酶使染料保持氧化状态,呈现蓝绿色,而在胞质内,染

5、料被还原成无色。线粒体浸没在JanusGreenB中能维持活性数小吋,可直接观察到生活状态线粒体的外形、分布及运动。线粒体制品经hnusGreenB特意染色后,光学显微镜下放大100倍镜检能够发现是否有线粒体存在及它的大小、形状、数量、结构。必须指出的是,只有具有活性的细胞色素C氧化酶才能够把詹纳斯绿B氧化,从而使它显出颜色,因此,在实验过程屮务必保持所取的材料的活性。通常,需要把生物材料賈于O'C〜4°C的冰水浴低温中,并且操作要迅速。3、动物线粒体DNA(mtDNA)的提取方法线粒体DNA(mtDNA)是一种封闭的双链环状分子,动物线粒体DNA为15〜1

6、9kb。动物线粒体DNA具有分子量小、结构简单、母性遗传和进化速度快等特点,己广泛应川于动物群体遗传学和进化生物学等领域的研究。本实验采用SDS裂解结合蛋白酶K消化的方法的提取mtDNA。SDS(十二烷基硫酸钠)破坏线粒体膜并使蛋白质变性,从而游离出核酸,EDTA抑制细胞中DNase活性,蛋白酶K进一步将蛋白质降解成小肽。之后加入饱和乙酸钠后,绝人部分线性大分子DNA和蛋白质在SDS作用卜变性形成沉淀,环状mtDNA仍为自然状态,通过高速离心,即W得到mtDNA。高盐沉淀法操作简单,易重复,产量多,可依需用量扩大反应体系,使mtDNA质量得以容易控制。4、m

7、tDNA的检测检测线粒体DNA浓度和纯度通常有3种方法,即琼脂糖凝胶电泳、限制性P、j切酶酶切和紫外分光光度计(UV)。琼脂糖凝胶电泳可以通过泳带颜色的深浅来判断其浓度,通过是否有拖带来确定其纯度,还可以通过分子量标记来确定mtDNA的大小。限制性内切酶酶切可以知道是否为基因组,如果是基因组,则不能酶切出淸晰的条带來;如果没有基因组污染,只要该mtDNA存在此酶切位点,就会酶切出条带來。紫外分光光度计可以测得A260和A260/A280,其•屮A260越大,其DNA的浓度也越大,反之越小。A260/A280—般介于1.6~2.0之间,如果A260/A280>

8、2.0,则此DNA可能有RNA污染,A260/A28

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