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时间:2018-11-21
《全自动(定量pcr)基因扩增诊断仪配套定量试剂的研制论文》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、全自动(定量PCR)基因扩增诊断仪配套定量试剂的研制论文.freelent-platemetricallyamplifiedbyabio-labeledup-streamprimer,thesinglestringPCRproductspleprobeandthepetitiveprobeined.Theresultofquanti-tativeassayplatecanbequantifiedbythiskit.ThesimplepreparationofsamplesDNAisalsoadaptedtothiskitandtheresultscanberepea
2、ted.CONCLUSIONThiskitcanbeusedininstru-mentandquantifythecontentofHBVDNAinserum.0引言用PCR技术进行核酸定量分析,有较大的难度.首先,PCR在扩增过程中,初期扩增产物量与循环数呈指数关系,在扩增后期进入平台期,定量分析应在指数关系区进行.但由于PCR扩增效率受多种因素的影响,使得这种定量条件很难控制.二是临床样品中待测核酸含量值跨度很大(可能在1~106拷贝/μL),对于跨度如此之大的检测对象,要进行准确定量本身就很困难.竞争PCR定量方法虽不受扩增平台期现象的影响,但该方法定量的量程
3、窄,要测定临床标本的核酸含量,就需用多个不同浓度的竞争模板分别对同一样品进行多次检测.为了克服竞争PCR定量方法的缺点,便于仪器自动检测,我们采用竞争PCR产物杂交―酶标显色法进行分级定量.这种定量方法克服了以往竞争PCR定量的不足,初步实现了半定量核酸分析.1材料和方法1.1材料主要仪器与试剂:全自动(定量PCR)基因扩增仪(本所);pUC19HBVDNA质粒为本所克隆.引物与探针:PCR引物源于HBVDNAX基因区[1],引物:B1(1402~1421)5’-BioATCCT-GCGCGGGACGTCCTT3’;B2(1626~1607)5’-CGTTCACGG
4、TGGTCTCCATG3’,探针位置与序列为(1600~1580)5’HRP-TGCACTTCGCAT-CACGTCTGG3’,其5’端标记有辣根过氧化物酶(HRP),由美国MaximBiotech.Inc制备.血清标本:72例HBVDNA阳性血清,由本校西京医院检验科提供.20例HBVDNA阴性血清,由本校西京医院中心血库提供.1.2方法经典DNA提取方法按文献[2]进行.简便DNA提取法:30μL血清加入30μL处理液(10mmolL-1Tris-HClpH8.0,1mmolL-1EDTA,1mLL-1NP40)煮沸15min,7000g离心5min,吸取上清5
5、μL作PCR模板[3].亲和素包被微孔板按文献[4]进行.不对称竞争PCR扩增[3]:PCR反应体积为30μL,其中引物B1,B2分别为50pmol,1pmol.扩增条件为:首先94℃预变性2min,然后94℃30s,60℃40s,72℃40s共循环25次,取PCR产物10μL进行杂交酶标显色.杂交酶标显色检测[5]:准确吸取两份PCR反应产物各10μL,按1∶9分别稀释(稀释液:4.3mmolL-1Na2HPO4,1.4mmolL-1K2HPO4;0.5mLL-1TmolL-1NaCl,2.7mmolL-1KCl,pH7.2)于待测微孔和竞争微孔中,混匀后,再分别
6、从中各吸取10μL溶液,再同样按1∶9分别稀释于新的待测微孔和竞争微孔中,混匀后,再同前稀释1次,这样待测产物和竞争产物各有3个微孔,稀释度分别为10-1,10-2,10-3,37℃放置10min,然后弃去微孔内溶液,用包被液洗2次,再加入100μL探针溶液(1μmolL-1探针),于震荡器上37℃震摇20min,用包被液洗微孔3次,加入显色底物100μL(0.1gL-1TMB,0.3mLL-1H2O2),37℃放置10min,加入0.5molL-1H2SO4终止液50μL终止显色反应,用全自动(定量PCR)基因扩增仪测定450nm下的吸光度(A)算出定量结果.2结
7、果2.1定量PCR方法的灵敏度将pUC19HBVDNA质粒定量稀释成每管105拷贝、104拷贝、103拷贝、102拷贝和10拷贝用该定量方法进行定量检测,循环程序为25次,准确吸取扩增产物10μL进行PCR产物杂交酶标显色,杂交酶标显色法可检测到初始模板量为10拷贝(Fig1).2.2杂交酶标显色法的特异性对10份HBVDNA阳性和10份HBVDNA阴性标本进行PCR扩增25个循环以后取产物进行杂交酶标显色,10份HBVDNA阳性标本最终A分别为1.121,3.000,2.080,2.258,0.646,1.252,1.143,0.389,0.912,0.537
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