噬菌体随机12肽库中vegf模拟表位的筛选及初步

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1、噬菌体随机12肽库中VEGF模拟表位的筛选及初步【摘要】目的:从噬菌体随机12肽库中筛选能与抗血管内皮生长因子(VEGF)mAb阿瓦斯汀(Avastin)特异性结合的多肽.方法:用Avastin为靶分子,对噬菌体12肽库进行3轮生物淘洗,随机挑取80个克隆,ELISA法鉴定其亲和性,将亲和性高的阳性克隆进行DNA序列测定,推导与噬菌体外壳融合的12肽氨基酸序列.Fmoc固相法合成12肽,戊二醛交联12肽与血蓝蛋白(KLH),打点印迹(Dotblot)检测偶联物能否与Avastin结合.结果:ELISA显示,42个噬菌体克隆与Avastin有较强的亲和性,测序发现41个阳

2、性克隆表达的融合12肽的序列一致,1个不同;化学合成的12肽能与Avastin特异性结合,12肽KLH偶联物也能与Avastin特异性结合.结论:初步证明12肽模拟了VEGF部分表位.【关键词】Avastin(bevacizumab)细菌噬菌体肽库血管内皮生长因子交联 0引言  血管生成是肿瘤生长和转移的前提[1].血管内皮生长因子(VEGF)是促进血管形成过程中的关键因子[2-3].肿瘤组织中VEGF表达水平与肿瘤血管化的程度、恶性程度呈正相关[4-5].因此,VEGF是肿瘤抗血管生成治疗中比较理想的靶分子.噬菌体随机肽库含有的大量不同序列结构多肽可作为任何靶抗原表

3、位的模拟肽,运用肽库筛选时不需要靶蛋白的任何结构,只需靶抗原的mAb就可以获得具有免疫原性和抗原性的多肽,它们反映了抗原结合位点的特定的构像[6-7].我们利用抗VEGFmAb阿瓦斯汀(Avastin)对噬菌体随机12肽库进行亲和筛选,旨在筛选出能与Avastin有高亲和力的噬菌体克隆,并分析其展示的多肽序列能否模拟VEGF的表位.  1材料和方法  1.1材料抗VEGFmAbAvastin(罗氏公司);噬菌体随机12肽库(新英格兰生物公司);PEG8000(华美生物公司);IPTG,XGal、辣根过氧化物酶(HRP)标记的抗噬菌体单克隆羊抗体(HRPantiM1

4、3,皮尔斯生物技术公司);血蓝蛋白(KLH,西格玛公司).550型ELISA读数仪(美国伯乐公司).  1.2方法  1.2.1VEGF模拟表位肽的筛选  1.2.1.1噬菌体库的生物淘洗用100g/LAvastin150μL包被96孔板的1个孔,4℃过夜,封闭后加入100μLTBST稀释10μL12肽库,室温作用1h,用1ml/LTBST冲洗10次.加入洗脱液(0.2mol/LGlycineHCl,1g/LBSA)100μL作用8min,吸出洗脱液,再用1mol/LTrisHCl15μL中和上述洗脱液.吸取1μL洗脱液测定滴度,其余液体加入20mLLB培养基(含E

5、R2738200μL,四环素贮液20μL)进行扩增和纯化.按以上步骤进行第2,3轮筛选,但分别用3,5mL/LTBST洗涤.  1.2.1.2阳性噬菌体的鉴定第3轮筛选完成后,挑选80个分割良好的噬菌体克隆分别进行扩增和纯化.将纯化好的噬菌体分别加入预先包被了Avastin和人IL15mAb(阴性对照)的96孔板中,室温作用1h;加入HRP标记的抗M13(1∶2000)抗体,作用1h.OPD显色,测定A490nm值,以A490nm值高于阴性对照2.1倍作为阳性克隆.  1.2.1.3阳性噬菌体与Avastin结合的剂量依赖实验以5mg/LAvastin包被96孔板,每

6、孔100μL,同时对每个Avastin包被孔设立IL15mAb的包被孔为阴性对照,4℃孵育过夜.加入封闭液(5mg/LBSA,0.1mol/LNaHCO3,pH8.6),4℃封闭2h,将阳性噬菌体稀释至5×1014pfu/L后作倍比稀释(pfu:噬菌斑形成单位),直至其滴度为1.9×1010pfu/L,分别加入Avastin及IL15mAb包被孔,100μL/孔,室温孵育2h,每孔加入HRP标记的小鼠抗M13噬菌体mAb(1∶5000)100μL,室温孵育1h,OPD显色后测定A490nm值.  1.2.1.4阳性噬菌体单链DNA的提取及测序取500μL上述噬菌体贮

7、液,加入200μLPEG8000/NaCl放置10min,离心10min,弃上清,沉淀重悬于100μL碘化物缓冲液中,加入250μL乙醇,室温作用100min,离心100min,弃上清,用700mL/L乙醇洗沉淀,短暂真空干燥.沉淀重悬于30μLTE(0.01mol/LTrisHCl,1mmol/LEDTA)中,取上述溶液5μL送上海生工生物公司测序.  1.2.2人工合成12肽与Avastin结合的剂量依赖实验将不同稀释度的合成12肽加入对应的孔中(初始浓度为16g/L,倍比稀释至终浓度为0.25g/L),每孔100μL,4℃过夜;封

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