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时间:2018-11-09
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1、何首乌及其混伪品序列相关扩增多态性反应体系的优化【摘要】 目的建立何首乌及其混伪品序列相关扩增多态性(SRAP)分子鉴定技术体系。方法正交优化影响SRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、引物浓度与Taq聚合酶量。结果20μl反应体系的优化组合为:Mg2+2.5mmol/L,dNTPs0.4mmol/L,引物0.35μmol/L,Taq酶1U。结论Mg2+、dNTPs、引物浓度与Taq聚合酶量对不同物种SRAP-PCR结果有不同程度影响,利用SRAP分子鉴定前应对此4因素进行优化。.L.编辑。【关键词】何首乌混伪品序列相关扩增多态性优化 Abstract:ObjectivEinordert
2、ocharacterizePolygonummultiflorumThunb.anditsadulterants,theSRAPmolecularmarkersystemizetheconcentrationsofMg2+,dNTPs,primersandTaqDNAolymerase.ResultsTheoptimumsystemof20μlmol/L,dNTPs0.4mmol/L,primer0.35μmol/L,TaqDNApolymerase1U.ConclusionTheconcentrationsofMg2+,dNTPs,primers,TaqDNAolymerasehavedi
3、fferenteffectintheresultofSRAP-PCRindifferentspecies.ItisnecessarytooptimizethesefourfactorsbeforeusingSRAPtoidentitydifferentspecies. KeymultiflorumThunb.;Adulterants;SRAP;Optimize 何首乌PolygonummultilorumThunb.是我国传统名贵中药,广东十大“道地药材”之一。近年来对其药理药效研究及开发应用越来越广。据研究报道其药用化学成分主要有蒽醌类、二苯乙烯类、芪类、多糖类等[1~4]。何首乌具有
4、降血脂[2]、增强免疫[3]、抗氧化[4]、护脑[5]等多种药效。除入药外,还被用于制取洗发水、首乌酒、保健品、食品和饲料添加剂等,开发前景十分广阔[6]。 然而,何首乌出现混伪品的历史久、地域广。本草中有混淆品宕芋的记载;河南、河北、甘肃、宁夏等地也有将翼蓼、毛脉蓼误做何首乌使用的历史[7];湖北省武当山、竹山、竹溪、房县均有把混淆品耳叶牛皮消作何首乌使用的习惯[8],且有不法商贩雕刻芭蕉块根为“人型何首乌”出售。混伪品的出现严重阻碍何首乌科研及应用,因此对何首乌及其混伪品的鉴定显得至关重要。 序列相关扩增多态性(Sequence-relatedamplifiedpolymorphis
5、m,SRAP)以操作简单、稳定性高、多态性丰富、易于测序[9~12]等优点在种质鉴定[13]、遗传多样性分析[11]、遗传连锁图构建[14]、基因连锁标记寻找[9]与基因的遗传变异[14,15]等方面得到广泛应用。且Ferriol等[16]发现与其它分子标记相比,SRAP在分子水平上与传统在形态学水平上建立的物种分类鉴定更加吻合。 SRAP分子鉴定技术基于PCR反应。一个优化的PCR反应体系极其重要,这关乎样本DNA所能扩增的条带数、清晰度及稳定性,从而影响后续的统计分析。为建立何首乌及其混伪品SRAP分子鉴定技术,本文首次对何首乌及其混伪品SRAP-PCR反应体系的主要影响因素进行了优化
6、,以期为何首乌及其混伪品鉴定提供前提条件。 1材料和方法 1.1材料实验所用引物及物种见表1~2。实验所用DNA聚合酶,TaKaRaTaq(DR001AM)。BSA(牛血清白蛋白),购自TaKaRa。 表1实验所用引物(略) 1.2DNA提取用TIANGEN的DNAsecurePlantKit提取经硅胶干燥保存的各物种叶片DNA,紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳法检测DNA质量合格,稀释为50ng/μl,-20℃保存。 表2实验所用物种(略) 1.3SRAP-PCR扩增采用L16(45)正交实验设计,对总体积为20μl的SRAP反应体系中的Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、T
7、aq聚合酶浓度进行4因素4水平的优化分析(表3~4),共16个处理。其它成分为:DNA模板(50ng/)1μl、Buffer(10X)2μl、BSA(0.1%)0.2μl,超纯水补足使终体积为20μl。所用引物对为me17-em1。 表3PCR反应的因素与水平(略) 扩增程序:94℃预变性5min;95℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸1min,5循环;94℃变性1min,48℃复性1min,
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