鼻咽癌组织dna聚合酶β基因突变与ebv感染相关

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1、鼻咽癌组织DNA聚合酶β基因突变与EBV感染相关郑红,李明善,赵国强,董子明,宋宝义【关键词】鼻咽肿瘤DNApolymeraseβgenemutationinhumannasopharyngealcanceranditsrelationshiperaseβ(polβ)genemutationinhumannasopharyngealcanceranditsrelationshipatissuesandcorrespondingnormalepithelialtissuesutationplifiedersandtheresu

2、ltsutationutationrate30.8%)andthereutationinjuxtacanceroustissues.ManytypesofmutationentindicatedthatthecasesofpolβSSCPabnormalannasopharyngealcarcinoma,inoacidandspatialstructurechange.ThesemutationsandEBVinfectionmayplayanimportantroleintumorgenesis.  【Keyeraseβ;

3、nasopharyngealneoplasms;genemutation;EBV  【摘要】目的:研究探讨鼻咽癌中DNA聚合酶β(DNApolymeraseβ,polβ)的变异情况及与EBV感染有无相关关系.方法:采用RTPCR法(逆转录DNA聚合酶链反应)、PCRSSCP(聚合酶链单链构象多态性分析)、DNA序列分析法对26例鼻咽癌组织及癌旁组织标本进行polβ基因突变研究.用特异性EBV引物PCR扩增法检测EB病毒,分析出现EBVPCR阳性与polβ突变及鼻咽癌发生之间的相关性.结果:polβSSCP结果显示癌旁组织标本

4、中polβ无突变;26例鼻咽癌组织标本中存在polβ基因变异的有8例,突变率为30.8%.polβ基因变异的鼻咽癌标本测序结果显示:核苷酸序列有多种形式的改变.提取DNA用EBV引物进行扩增,26例鼻咽癌标本中出现阳性的有24例,阳性率为92.3%.结论:首次发现在鼻咽癌中存在多种形式的polβ突变,有polβ突变的病例均有EBV感染.  【关键词】DNA聚合酶β;鼻咽肿瘤;基因,突变;EB病毒  0引言  DNA聚合酶β(DNApolymeraseβ,polβ)是一种修复酶,在哺乳动物细胞中参与DNA的合成和修复的某些过程

5、〔1,2〕.其缺陷与一些肿瘤的发生有关,在人类多种肿瘤中存在polβ突变〔3,4〕.然而有关鼻咽癌中有无polβ基因突变尚少见报道.我们采集鼻咽癌(nasopharynxcancer,NPC)及癌旁组织(juxtacanceroustissue,JCT)标本,进行polβ基因突变调查,检测EBV感染,并分析与polβ突变间的关系如下.  1材料和方法  1.1材料  鼻咽癌标本26例(NPCaz)病理证实为鳞状上皮细胞癌,每份标本取癌组织和癌旁正常组织各1块,标本离体后迅速置于液氮中保存.参考GenBank的M13740序列

6、设计出7对SSCP引物,1对完整的全基因序列引物.参考GenBank的M20820的EBV病毒序列设计出1对EBVPCR检测引物〔5〕.  1.2方法  按照RNA提取试剂盒步骤进行提取总RNA;逆转录合成cDNA,进行七区段扩增;取PCR扩增产物与变性载样缓冲液混匀,在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳.取下凝胶,银染后照相记录并分析SSCP结果;PCR产物与pGEMT载体连接,转化入JM109细胞中进行PCR产物的克隆;用碱裂解法提取质粒DNA,利用荧光标记法ABI377测序仪双向测定DNA序列(由上海生工公司完成).所得结果利用

7、DNASIS软件与GenBank中查到的DNApolβ基因进行同源比较和分析.按照Qiagen公司DNA提取试剂盒说明提取组织的DNA;以去离子水为阴性对照,以EBV为阳性对照进行EBVDNA的PCR扩增;取PCR扩增产物溴酚蓝加样缓冲液充分混合后,于20g/L琼脂糖凝胶上电泳,紫外光下观察扩增结果.  2结果  在26例鼻咽癌组织中有8例SSCP异常,突变率为30.8%(Fig1).而对应的26例癌旁组织中未见异常;鼻咽癌组织polβ突变位点见Tab1;DNASIS软件Choufasman算法推测polβ肽段二级结构;在2

8、6例鼻咽癌及对应癌旁组织中共检出,EBVDNA阳性的24例(癌及对应癌旁组织一致),EBVDNA的阳性率为92.3%(Fig2).表1鼻咽癌组织中polβ突变位点及类型(略)  3讨论  polβ是一重要的DNA修复酶,该酶基因的突变与肿瘤的发生密切〔6〕.由于PCRSSCP技术的引入,使

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