欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:21858949
大小:3.50 MB
页数:70页
时间:2018-10-25
《药学专业论文》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、本科学生毕业设计(论文)抗糖尿病药物的虚拟筛选模型设计摘要糖尿病的发病率高、病情复杂、病程长、难根治等特点使其成为与心脑血管、肿瘤相并列的严重危害人类健康的3大病种之一。虚拟筛选已成为研发新药中的一个重要组成部分。近年来以PPARs为靶标的抗糖尿病药物出现了肝脏毒性、水肿与心血管系统副作用、肾脏毒性、体重增加等毒副作用,这些药物大部分是PPARs的双重激动剂或三重激动剂,并且对于PPAR三种亚型中的δ亚型的研发较少。基于这些问题,本课题研究者通过对已知药物及活性化合物与PPAR靶标的作用机理研究,运用分子模拟软件和分子对
2、接软件GOLD,分别建立基于PPARα、δ、γ的三个药物虚拟筛选模型,对模型进行验证,并选取文献中一系列活性小分子与所建模型进行对接,计算结果与实验结果对比分析,改变计算条件进行实验结果分析。本课题研究者还研究了PPAR激动剂的结合方式。本课题中建立的PPARα、δ、γ虚拟筛选模型能较好的重现激动剂的结合构象,选取的打分函数Goldscore和Chemscore都对较高活性的小分子有活性富集的作用。课题通过研究PPAR激动剂的结合方式,得到了如下结论:在PPAR激动剂的结合方式中氢键的形成起着重要的作用:与PPARα结合
3、时要获得较高的激活活性,小分子的结构中一端需具有能与蛋白质残基SER280的OG原子、TYR314的OH原子、TYR464的OH原子、HIS440的NE2原子形成O-O型氢键或O-N型氢键的官能团;与PPARδ结合是时要获得较高的激活活性,小分子的结构中一端需具有能与蛋白质残基HIS323的NE2原子,TYR473的OH原子,HIS449的NE2原子,THR289的OG1原子形成O-O型氢键或O-N型氢键的官能团;与PPARγ结合是时要获得较高的激活活性,小分子的结构中一端需具有能与蛋白质残基HIS449的NE2原子,T
4、YR473的OH原子,HIS323的NE2原子,SER289的OG原子形成O-O型氢键或O-N型氢键的官能团。关键词:糖尿病,过氧化酶增殖体激活受体,虚拟筛选,分子对接ABSTRACTDiabeteshasbecomeoneofthreemajordiseaseswithitscharacteristicssuchaslonganddifficulttocure,highincidence,illnesscomplicated.Virtualscreeninghasbecomeoneoftheimportantdurin
5、gdrugdevelopment.AntidiabeticdrugswhosetargetsarePPARshavesomesideeffectssuchasliertoxicity,kidneytoxicity.Mostofthesedrugsaredoubleagonistsortripleagonists.Ther&dofPPARdeltafromthethreePPARsub-typesislessthantheothers.Basedontheseproblems,thistopicresearcherthro
6、ughtheresearchofmechanismbetweenactivecompoundsandPPARsestablishthreevirtualscreeningmodelswhobasedonPPARα、δ、γsub-typeswithusingmolecularsimulationsoftwareandmoleculardockingsoftware.Andthentestedthesemodels.Theresearchersalsoresearchedthewayofthecombinationbetwe
7、entheagonistsandPPARs.Thethreevirtualscreeningmodelswhichhavebeenestablishedinthistopiccanrecreateagoodcombinationofagonistsconformation.ThescoringfunctionsChemscoreandGoldscoreplayaroleofactiveenrichmentduringmoleculardocking.Theresearchershavethefollowingconclu
8、sionsthroughresearchedthecombinationwayofPPARagonists.HydrogenbondingsplayanimportantpartinthecombinationbetweentheagonistsandPPARs.Toobtainhigheractivitydurin
此文档下载收益归作者所有